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R语言 secr包 LLsurface.secr()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-9-29 23:58:46 | 显示全部楼层 |阅读模式
LLsurface.secr(secr)
LLsurface.secr()所属R语言包:secr

                                         Plot likelihood surface
                                         图可能面

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Calculate log likelihood over a grid of values of two beta parameters from a fitted secr model and optionally make an approximate contour plot of the log likelihood surface.
计算对数似然一格的两个测试从一个装有SECR模型的参数值,并有选择地进行近似对数似然面的等高线图。


用法----------Usage----------


LLsurface.secr(object, betapar = c("g0", "sigma"), xval = NULL,
    yval = NULL, centre = NULL, realscale = TRUE, plot = TRUE,
    plotfitted = TRUE, ...)



参数----------Arguments----------

参数:object
secr object output from secr.fit  
secr对象输出secr.fit


参数:betapar
character vector giving the names of two beta parameters  
字符向量给两个测试参数的名称


参数:xval
vector of numeric values for x-dimension of grid  
数值x维网格的向量


参数:yval
vector of numeric values for y-dimension of grid  
网格的y维度的数值的矢量


参数:centre
vector of central values for all beta parameters  
矢量的所有测试参数的中心值


参数:realscale
logical. If TRUE input and output of x and y is on the untransformed (inverse-link) scale.  
逻辑。如果为TRUE,x和y的输入和输出是在未转化的(反向链路)的规模。


参数:plot
logical. If TRUE a contour plot is produced  
逻辑。如果是真正的等高线图


参数:plotfitted
logical. If TRUE the MLE from object is shown on the plot (+)  
逻辑。如果为true,MLE从object的图(+)


参数:...
other arguments passed to contour  
其他参数传递给contour


Details

详细信息----------Details----------

centre is set by default to the fitted values of the beta parameters in object. This has the effect of holding parameters other than those in betapar at their fitted values.
centre设置的测试参数的拟合值默认情况下,在object。这具有比那些在betapar在其拟合值保持其它参数的影响。

If xval or yval is not provided then 11 values are set at equal spacing between 0.8 and 1.2 times the values in centre (on the "real" scale if realscale = TRUE and on the "beta" scale otherwise).
如果xval或如果yval centre不提供设置11值之间以相等间隔的0.8倍和1.2倍的值realscale(真正的规模 = TRUE和测试版规模以其他方式)。

Contour plots may be customized by passing graphical parameters through the ... argument.
等高线图,通过图形参数,通过可自定义...的说法。


值----------Value----------

Invisibly returns a matrix with the log likelihood evaluated at each grid point
无形返回一个评估,在每个格点矩阵的对数似然


注意----------Note----------

LLsurface.secr works for named "beta" parameters rather than "real" parameters. The default realscale = TRUE only works for beta parameters that share the name of the real parameter to which they relate i.e. the beta parameter for the base level of the real parameter. This is because link functions are defined for real parameters not beta parameters.
LLsurface.secr命名为测试版的参数,而不是“真正”的参数。默认realscale = TRUE只有共享的名字,真正的相关参数,即实参的基本水平的测试参数测试参数。这是因为链接功能被定义为实际参数测试参数。

The contours are approximate because they rely on interpolation. See Examples for a more reliable way to compare the likelihood at the MLE with nearby points on the surface.
的轮廓近似的,因为它们依赖于插值。一个更可靠的方法来比较的可能性极大似然估计与附近的表面上的点的例子。


实例----------Examples----------


## Not run: [#不运行:]
LLsurface.secr(secrdemo.CL, xval = seq(0.16,0.40,0.02),
    yval = 25:35, nlevels = 20)

## now verify MLE[#现在验证MLE]
## click on MLE and apparent `peak'[#单击“对MLE和明显的高峰”]
xy <- locator(2)
temp <- LLsurface.secr(secrdemo.CL, xval = xy$x,
     yval = xy$y, plot = FALSE)
temp

## End(Not run)[#(不执行)]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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