optim.thresh(SDMTools)
optim.thresh()所属R语言包：SDMTools
Estimation of Optimal Threshold Values
估计最优阈值
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
optim.thresh estimates optimal threshold values given eight methods. <br> <br> Note: this method will exclude any missing data.
optim.thresh估计最优阈值的八个方法。 <br> <br>请注意：此方法将排除任何丢失的数据。
用法----------Usage----------
optim.thresh(obs,pred,threshold)
参数----------Arguments----------
参数：obs
a vector of observed values which must be 0 for absences and 1 for occurrences
必须为0缺勤和1出现的观测值的向量
参数：pred
a vector of the same length as obs representing the predicted values. Values must be between 0 & 1 representing a likelihood.
obs表示的预测值相同的长度的矢量。值必须在0和1之间的可能性。
参数：threshold
a single integer value representing the number of equal interval threshold values between 0 & 1
一个整数值表示的数量等间隔的阈值在0和1之间的值
值----------Value----------
Returns a list of the optimal thresholds for the different methods. If the list item is a single value, that is the optimal threshold but if two values are reported for the method, this represents the range in thresholds that are equal for that threshold selection method. <br> <br> The returned list includes the single or range in thresholds selected using the following methods:
返回一个列表，为不同的方法的最佳阈值。如果该列表项是一个单一的值，这是最佳的阈值，但如果两个值中报告的方法，这表示的范围内的阈值，该阈值选择方法是相等的。参考参考返回的列表包括单人或阈值范围内选择使用下面的方法：
参数：min.occurence.prediction
is the minimum prediction for the occurrence (presence) records
是的发生（存在）记录的最低预测
参数：mean.occurence.prediction
is the mean prediction for the occurrence (presence) records
是的发生（存在）的平均预测记录
参数：'10.percent.omission'
is the threshold value or range in values that excludes approx. 10 percent of the occurrence records
是阈值或范围的值中不包括约。 10％的发生记录
参数：'sensitivity=specificity'
is the threshold value or range in values where sensitivity is equal to sensitivity
是阈值或范围中的值，其中灵敏度是等于灵敏度
参数：'max.sensitivity+specificity'
is the threshold value or range in values that maximizes sensitivity plus specificity
是阈值或值的范围内，最大限度地提高灵敏度，加上特异性
参数：maxKappa
is the threshold value or range in values with the maximum Kappa statistic
是阈值或范围中的最大Kappa统计值与
参数：max.prop.correct
is the threshold value or range in values with the maximum proportion of presence and absence records correctly identified
是在最高比例的存在和不存在正确标识的记录的值与阈值或范围
参数：min.ROC.plot.distance
is the threshold value or range in values where the ROC curve is closest to point (0,1) (or perfect fit)
是阈值或范围中值，其中最接近的ROC曲线的点（0,1）（或完美契合）
（作者）----------Author(s)----------
Jeremy VanDerWal <a href="mailto:jjvanderwal@gmail.com">jjvanderwal@gmail.com</a>
参见----------See Also----------
accuracy, auc, Kappa, omission, sensitivity, specificity, prop.correct, confusion.matrix
accuracy，auc，Kappa，omission，sensitivity，specificity，prop.correct，confusion.matrix
实例----------Examples----------
#create some data[创建一些数据]
obs = c(sample(c(0,1),20,replace=TRUE),NA); obs = obs[order(obs)]
pred = runif(length(obs),0,1); pred = pred[order(pred)]
#calculate the optimal thresholds[计算的最佳的阈值]
optim.thresh(obs,pred)
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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。
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发表于 2012-9-29 23:36:00
