sda-package(sda)
sda-package()所属R语言包:sda
The sda package
SDA包
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This package performs linear discriminant analysis (LDA) and diagonal discriminant analysis (DDA) with variable selection using correlation-adjusted t (CAT) scores.
这个包进行线性判别分析(LDA)和对角线的判别分析(DDA)与变量选择使用相关调整T(CAT)破门得分。
The classifier is trained using James-Stein-type shrinkage estimators. Variable selection is based on ranking predictors by CAT scores (LDA) or t-scores (DDA). A cutoff is chosen by false non-discovery rate (FNDR) or higher criticism (HC) thresholding.
詹姆斯斯坦型收缩估计分类器训练。变量的选择是基于排名的预测的CAT评分(LDA)或T-分数(DDA)。一个的截止选择的假非发现率(FNDR)的或更高的批评(HC)阈值。
This approach is particularly suited for high-dimensional classification with correlation among predictors. For details see Zuber and Strimmer (2009) and Ahdesm\"aki and Strimmer (2010).
这种方法特别适合于与预测变量之间的相关性高维分类。有关详细信息,请参阅朱伯和Strimmer的(2009)和Ahdesm \“AKI和Strimmer的(2010)。
Typically the functions in this package are applied in three steps:
通常情况下,该包中的功能应用分为三个步骤:
Step 1:feature selection with sda.ranking,
第1步:特征选择与sda.ranking
Step 2:training the classifier with sda, and
第2步:培训的分类与sda,
Step 3:classification using predict.sda.
第3步:分类predict.sda。
The accompanying web site (see below) provides example R scripts to illustrate the functionality of this package.
附带的网站(见下文)R脚本示例来说明这个包的功能。
(作者)----------Author(s)----------
Miika Ahdesm\"aki, Verena Zuber and Korbinian Strimmer (<a href="http://strimmerlab.org/">http://strimmerlab.org/</a>)
参考文献----------References----------
using cat scores and false non-discovery rate control. Ann. Appl. Stat. 4: 503-519. Preprint available from http://arxiv.org/abs/0903.2003.
Bioinformatics 25: 2700-2707. Preprint available from http://arxiv.org/abs/0902.0751.
参见----------See Also----------
catscore, sda.ranking, sda, predict.sda.
catscore,sda.ranking,sda,predict.sda。
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