rowMAFs(scrime)
rowMAFs()所属R语言包:scrime
Rowwise Minor Allele Frequency
Rowwise次要等位基因频率
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Computes for each SNP represented by a row of a matrix the frequency of the minor allele.
计算为每个SNP的行所表示的矩阵的次要等位基因频率。
用法----------Usage----------
rowMAFs(x, check = TRUE)
参数----------Arguments----------
参数:x
a matrix in which each row represents a SNP and each column a subject, where the genotypes of each SNP are coded by 1 (for the homozygous reference genotype), 2 (heterozygous), and 3 (homozygous variant). NAs are also allowed.
的矩阵中的每一行代表一个SNP和每一列的被摄体,其中每个SNP的基因型被编码的1(纯合子参考基因型),2(杂合子),和3(纯合子变种)。 NAS的也是允许的。
参数:check
should it be checked if the matrix contains values differing from 1, 2, and 3? It is highly recommended to leave check = TRUE. Setting check = FALSE reduces the computation time only slightly.
它应该被检查,如果矩阵中包含不同的1,2,和3的值?它强烈建议离开check = TRUE的。设置check = FALSE降低了计算时间仅略。
值----------Value----------
a vector containing the minor allele frequency of the SNPs represented by x.
一个向量,包含未成年人的单核苷酸多态性等位基因频率为代表的x。
(作者)----------Author(s)----------
Holger Schwender, <a href="mailto:holger.schwender@udo.edu">holger.schwender@udo.edu</a>
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注:
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