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R语言 scrime包 predictFBLR()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-9-29 23:02:56 | 显示全部楼层 |阅读模式
predictFBLR(scrime)
predictFBLR()所属R语言包:scrime

                                         Predict Case Probabilities with Full Bayesian Logic Regression
                                         预测案例概率的全贝叶斯逻辑回归

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Predicts case probabilities for binary data (usually SNP data dichotomized with snp2bin) based on an MCMC sample of Bayesian logic regression models obtained with fblr.
预测情况的概率为二进制数据(通常SNP数据虚拟与snp2bin)的基础上获得fblr贝叶斯逻辑回归模型的MCMC样本。


用法----------Usage----------


predictFBLR(file, bin, kmax = 10, int.level = 2)



参数----------Arguments----------

参数:file
character string naming file where MCMC sample is stored.
MCMC样本存储的字符串命名文件。


参数:bin
matrix of binary variables to make predictions for. One row is one observation. The number of binary variables has to be the same as used in fblr.
矩阵的二元变量进行预测。一个行是一个观察。二进制变量的数目是在fblr所用的相同。


参数:kmax
the maximum number of allowed logic predictors used in fblr.
用于fblr允许逻辑预测因子的最大数目。


参数:int.level
the maximum number of allowed binaries in a logic predictor  used in fblr.</table>
允许二进制文件的最大数量的逻辑预测fblr。</ TABLE>


值----------Value----------

Vector of length nrow(bin) with predicted case probabilities.
向量的长度nrow(bin)与预测的情况下,概率的。


(作者)----------Author(s)----------


Arno Fritsch, <a href="mailto:arno.fritsch@uni-dortmund.de">arno.fritsch@uni-dortmund.de</a>



参见----------See Also----------

fblr
fblr


实例----------Examples----------


# Use fblr on some simulated SNP data[使用fblr一些模拟的SNP数据]
snp <- matrix(rbinom(500 * 20, 2, 0.3), ncol = 20)
bin <- snp2bin(snp)
int <- apply(bin,1,function(x) (x[1] == 1 &amp; x[3] == 0)*1)
case.prob <- exp(-0.5+log(5)*int)/(1+exp(-0.5+log(5)*int))
y <- rbinom(nrow(snp),1,prob=case.prob)
fblr(y, bin, niter=1000, nburn=0)

# Prediction for some new observations [预测一些新的意见]
newbin <- snp2bin(matrix(rbinom(100 * 20, 2, 0.3), ncol = 20))
predictFBLR("fblr_mcmc.txt",newbin)


## End(Not run)[#(不执行)]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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