R语言 scape包 importCol()函数中文帮助文档(中英文对照)

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importCol(scape)
importCol()所属R语言包：scape

                                        Import Coleraine Model Results
                                         进口科尔雷恩模型结果

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Import Coleraine model results from .res file, and rearrange into a standard format suitable for plotting.
导入的科尔雷恩模型结果。res文件，并重新安排适合用于绘制成标准格式。


用法----------Usage----------


importCol(res.file, info="", Dev=FALSE, CPUE=FALSE, Survey=FALSE,
          CAc=FALSE, CAs=FALSE, CLc=FALSE, CLs=FALSE, LA=FALSE,
          quiet=TRUE, ...)



参数----------Arguments----------

参数：res.file
name of Coleraine model results file to import.
名的科尔雷恩模型的结果文件中导入。


参数：info
optional string containing information to store with model results.
可选的字符串，其中包含的信息存储与模型结果。


参数：Dev
whether recruitment deviates were estimated in model.
是否招聘偏离估计模型。


参数：CPUE
whether model was fitted to catch-per-unit-effort data.
是否是安装在追赶每单位努力量数据。


参数：Survey
whether model was fitted to survey abundance index data.
调查丰度指数数据模型拟合。


参数：CAc
whether model was fitted to commercial catch-at-age data.
模型拟合的商业追赶年龄数据。


参数：CAs
whether model was fitted to survey catch-at-age data.
是否模型拟合调查追赶年龄数据。


参数：CLc
whether model was fitted to commercial catch-at-length data.
模型是否嵌合的商业追赶长度数据。


参数：CLs
whether model was fitted to survey catch-at-length data.
模型是否嵌合调查追赶长度数据。


参数：LA
whether model was fitted to length-at-age data.
模型拟合长度年龄数据。


参数：quiet
whether to report progress while parsing file.
是否要汇报工作进度，在解析文件。


参数：...
passed to data.frame, e.g. stringsAsFactors=FALSE.
传递的data.frame，例如stringsAsFactors=FALSE。


值----------Value----------

A list of class scape containing at least N, B, and Sel. The other elements may or may not be included in the list, depending on how importCol was called: <table summary="R valueblock"> <tr valign="top"><td>N</td> <td> predicted numbers at age</td></tr> <tr valign="top"><td>B</td> <td> predicted biomass, recruitment, and observed landings (year things)</td></tr> <tr valign="top"><td>Sel</td> <td> predicted selectivity and observed maturity (age things)</td></tr> <tr valign="top"><td>Dev</td> <td> predicted recruitment deviates from the stock-recruitment curve</td></tr> <tr valign="top"><td>CPUE, Survey</td> <td> commercial and survey abundance index and fit</td></tr> <tr valign="top"><td>CAc, CAs</td> <td> commercial and survey C@A (catch at age) and fit</td></tr> <tr valign="top"><td>CLc, CLs</td> <td> commercial and survey C@L (catch at length) and fit</td></tr> <tr valign="top"><td>LA</td> <td> observed L@A and fit</td></tr> </table>
列表类scape至少包含N，B，Sel。其他因素可能会或可能不会被包含在列表中，这取决于如何importCol被称为：<table summary="R valueblock"> <tr valign="top"> <TD>N / TD> <TD>的预测数字，在年龄</ TD> </ TR> <tr valign="top"> <TD> B </ TD> <TD>预测的生物量，招聘，并观察着陆（今年的东西）</ TD> </ TR> <tr valign="top"> <TD>Sel </ TD> <TD>的预测选择性和观察到的成熟年龄的事情</ TD> </ TR > <tr valign="top"> <TD> Dev </ TD> <TD>预测的股票招募曲线的招聘偏离</ TD> </ TR> <tr valign="top"> < TD> CPUE, Survey </ TD> <TD>商业和调查丰度指数，适合</ TD> </ TR> <tr valign="top"> <TD> CAc, CAs</ TD> < TD>商业和调查c @ A（捕捉岁），适合</ TD> </ TR> <tr valign="top"> <TD>CLc, CLs</ TD> <TD>商业和调查&#199; @ L（捕捉长度），适合</ TD> </ TR> <tr valign="top"> <TD>LA </ TD> <TD>观察到L @ A和适合</ TD> </ TR> </ TABLE>


注意----------Note----------

This import function is implemented for the Coleraine statistical catch-at-age software, and can serve as a template for scape users who would like to implement import functions for specific stock assessment software.
此导入功能来实现的科尔雷恩统计追赶时代的软件，并且可以作为一个模板，scape用户想实现具体的股票评估软件的导入功能。

The functions ll (package gdata) and head are recommended for browsing model results, e.g. ll(x.cod);     ll(x.cod$N); head(x.cod$N).
的功能ll（包gdata）head推荐用于浏览模型的结果，例如： ll(x.cod);     ll(x.cod$N); head(x.cod$N)。


参考文献----------References----------

Hilborn, R., M. Maunder, A. Parma, B. Ernst, J. Payne, and P. Starr. 2003. <CITE>Coleraine: A generalized age-structured stock assessment model.</CITE> User's manual version 2.0. University of Washington Report SAFS-UW-0116. Available at http://fish.washington.edu/research/coleraine/pdf/coleraine.pdf.

参见----------See Also----------

read.table, readLines, and scan import any data.
read.table，readLines和scan导入任何数据。

x.cod, x.ling, x.oreo, and x.sbw were created using importCol.
x.cod，x.ling，x.oreo和x.sbw创建的使用importCol。

scape-package gives an overview of the package.
scape-package给出了一个概述的包。


实例----------Examples----------


## Not run: [＃不运行：]
path <- system.file("example/cod.res", package="scape")
x.cod <- importCol(path, Dev=TRUE, Survey=TRUE, CAc=TRUE, CAs=TRUE)

## End(Not run)[＃（不执行）]

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