R语言 scapeMCMC包 plotTrace()函数中文帮助文档(中英文对照)

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plotTrace(scapeMCMC)
plotTrace()所属R语言包：scapeMCMC

                                        Plot MCMC Traces
                                         图MCMC的痕迹

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Plot Markov chain Monte Carlo traces. This is a diagnostic plot for deciding whether a chain shows unwanted trends.
图马尔可夫链蒙特卡罗的痕迹。这是一个诊断的图决定是否链不需要的趋势。


用法----------Usage----------


plotTrace(mcmc, axes=FALSE, same.limits=FALSE,
          between=list(x=axes,y=axes), div=1, span=1/4, log=FALSE,
          base=10, main=NULL, xlab=NULL, ylab=NULL, cex.main=1.2,
          cex.lab=1, cex.axis=0.8, cex.strip=0.8, col.strip="gray95",
          las=0, tck=0.5, tick.number=5, lty.trace=1, lwd.trace=1,
          col.trace="gray", lty.median=1, lwd.median=1,
          col.median="black", lty.loess=2, lwd.loess=1,
          col.loess="black", plot=TRUE, ...)



参数----------Arguments----------

参数：mcmc
MCMC chain(s) as a vector, data frame or mcmc object.
MCMC链（S）作为向量，数据框或mcmc对象的。


参数：axes
whether axis values should be plotted.
是否应绘制轴值。


参数：same.limits
whether panels should have same x-axis limits.
板是否应该有相同的X轴范围。


参数：between
list with x and y indicating panel spacing.
列表x和y显示面板的间距。


参数：div
denominator to shorten values on the y axis.
分母，以缩短在y轴上的值。


参数：span
smoothness parameter, passed to panel.loess
平滑参数传递给panel.loess


参数：log
whether values should be log-transformed.
是否值应该是对数转换。


参数：base
logarithm base.
对数的底。


参数：main
main title.
主标题。


参数：xlab
x-axis title.
X轴标题。


参数：ylab
y-axis title.
Y轴标题。


参数：cex.main
size of main title.
主标题的大小。


参数：cex.lab
size of axis labels.
轴标签的大小。


参数：cex.axis
size of tick labels.
大小的刻度标记。


参数：cex.strip
size of strip labels.
条标签的大小。


参数：col.strip
color of strip labels.
条标签的颜色。


参数：las
orientation of tick labels: 0=parallel, 1=horizontal, 2=perpendicular, 3=vertical.
0 =并行，1 =水平，垂直，2 = 3 =垂直方向的刻度标签：。


参数：tck
tick mark length.
刻度线的长度。


参数：tick.number
number of tick marks.
的刻度数。


参数：lty.trace
line type of trace.
直线型的痕迹。


参数：lwd.trace
line width of trace.
线宽度的痕迹。


参数：col.trace
color of trace.
颜色的痕迹。


参数：lty.median
line type of median.
直线型的中位数。


参数：lwd.median
line width of median.
的中位线宽度。


参数：col.median
color of median.
颜色的中位数。


参数：lty.loess
line type of loess.
直线型的黄土。


参数：lwd.loess
line width of loess.
线宽度的黄土。


参数：col.loess
color of loess.
黄土的颜色。


参数：plot
whether to draw plot.
是否绘制的图。


参数：...
passed to xyplot and panel.loess.
传递xyplot和panel.loess。


值----------Value----------

When plot=TRUE, a trellis plot is drawn and a data frame is returned, containing the data used for plotting. When plot=FALSE, a trellis object is returned.
当plot=TRUE，一个网格图的绘制，并返回一个数据框，包含的数据用于绘制。当plot=FALSE，返回一个网格对象。


注意----------Note----------

The Args function from the gdata package is recommended for reviewing the arguments, instead of args.
建议审查的论点，而不是Argsgdata功能args包。


参见----------See Also----------

xyplot and panel.loess are the underlying drawing functions, and traceplot is a similar non-trellis plot.
xyplot和panel.loess是底层的绘图功能，和traceplot是一个类似的非格子图。

plotTrace, plotAuto, plotCumu, and plotSplom are diagnostic plots.
plotTrace，plotAuto，plotCumu和plotSplom是诊断图。

plotDens and plotQuant are posterior plots.
plotDens和plotQuant后图。

scapeMCMC-package gives an overview of the package.
scapeMCMC-package给出了一个概述的包。


实例----------Examples----------


plotTrace(xmcmc$P, xlab="Iterations", ylab="Parameter value",
          layout=c(2,4))
plotTrace(xmcmc$P$R0, axes=TRUE, div=1000)

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