plotDens(scapeMCMC)
plotDens()所属R语言包：scapeMCMC
Plot MCMC Density
图MCMC密度
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Plot Markov chain Monte Carlo density. This is an approximation of the posterior probability density function.
图马尔可夫链蒙特卡罗密度。这是一个近似的后验概率密度函数。
用法----------Usage----------
plotDens(mcmc, probs=c(0.025,0.975), points=FALSE, axes=TRUE,
same.limits=FALSE, between=list(x=axes,y=axes), div=1,
log=FALSE, base=10, main=NULL, xlab=NULL, ylab=NULL,
cex.main=1.2, cex.lab=1, cex.axis=0.8, cex.strip=0.8,
col.strip="gray95", las=0, tck=0.5, tick.number=5,
lty.density=1, lwd.density=3, col.density="black",
lty.median=2, lwd.median=1, col.median="darkgray", lty.outer=3,
lwd.outer=1, col.outer="darkgray", pch="|", cex.points=1,
col.points="black", plot=TRUE, ...)
参数----------Arguments----------
参数：mcmc
MCMC chain(s) as a vector, data frame or mcmc object.
MCMC链（S）作为向量，数据框或mcmc对象的。
参数：probs
vector of outer quantiles to draw, besides the median.
外位数的向量绘制，除了中位数。
参数：points
whether data points should be plotted along the x axis.
数据点是否应绘制沿x轴。
参数：axes
whether axis values should be plotted.
是否应绘制轴值。
参数：same.limits
whether panels should have same x-axis limits.
板是否应该有相同的X轴范围。
参数：between
list with x and y indicating panel spacing.
列表x和y显示面板的间距。
参数：div
denominator to shorten values on the x axis.
分母，以缩短在x轴上的值。
参数：log
whether values should be log-transformed.
是否值应该是对数转换。
参数：base
logarithm base.
对数的底。
参数：main
main title.
主标题。
参数：xlab
x-axis label.
X轴标签。
参数：ylab
y-axis label.
y轴的标签。
参数：cex.main
size of main title.
主标题的大小。
参数：cex.lab
size of axis labels.
轴标签的大小。
参数：cex.axis
size of tick labels.
大小的刻度标记。
参数：cex.strip
size of strip labels.
条标签的大小。
参数：col.strip
color of strip labels.
条标签的颜色。
参数：las
orientation of tick labels: 0=parallel, 1=horizontal, 2=perpendicular, 3=vertical.
0 =并行，1 =水平，垂直，2 = 3 =垂直方向的刻度标签：。
参数：tck
tick mark length.
刻度线的长度。
参数：tick.number
number of tick marks.
的刻度数。
参数：lty.density
line type of density curve.
密度曲线的线类型。
参数：lwd.density
line width of density curve.
密度曲线的线宽度。
参数：col.density
color of density curve.
密度曲线的颜色。
参数：lty.median
line type of median.
直线型的中位数。
参数：lwd.median
line width of median.
的中位线宽度。
参数：col.median
color of median.
颜色的中位数。
参数：lty.outer
line type of outer quantiles.
线路类型外位数。
参数：lwd.outer
line width of outer quantiles.
外分位数的线宽度。
参数：col.outer
color of outer quantiles.
外位数的颜色。
参数：pch
symbol for data points.
的数据点上的符号。
参数：cex.points
size of data points.
的数据点的大小。
参数：col.points
color of data points.
色的数据点。
参数：plot
whether to draw plot.
是否绘制的图。
参数：...
passed to densityplot and panel.densityplot.
传递densityplot和panel.densityplot。
值----------Value----------
When plot=TRUE, a trellis plot is drawn and a data frame is returned, containing the data used for plotting. When plot=FALSE, a trellis object is returned.
当plot=TRUE，一个网格图的绘制，并返回一个数据框，包含的数据用于绘制。当plot=FALSE，返回一个网格对象。
注意----------Note----------
The Args function from the gdata package is recommended for reviewing the arguments, instead of args.
建议审查的论点，而不是Argsgdata功能args包。
参见----------See Also----------
xyplot and panel.densityplot are the underlying drawing functions, and link[coda]{densplot} is a similar non-trellis plot.
xyplot和panel.densityplot是底层的绘图功能，和link[coda]{densplot}是一个类似的非格子图。
plotTrace, plotAuto, plotCumu, and plotSplom are diagnostic plots.
plotTrace，plotAuto，plotCumu和plotSplom是诊断图。
plotDens and plotQuant are posterior plots.
plotDens和plotQuant后图。
scapeMCMC-package gives an overview of the package.
scapeMCMC-package给出了一个概述的包。
实例----------Examples----------
plotDens(xmcmc$B$"2004", points=TRUE, div=1000, main="2004\n",
xlab="Biomass age 4+ (1000 t)", tick.number=6, strip=FALSE)
plotDens(xmcmc$P, xlab="Parameter value", ylab="Posterior density\n")
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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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发表于 2012-9-29 22:41:19
