R语言 scapeMCMC包 importMCMC()函数中文帮助文档(中英文对照)

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importMCMC(scapeMCMC)
importMCMC()所属R语言包：scapeMCMC

                                        Import Coleraine MCMC Results
                                         进口科尔雷恩MCMC

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Import Coleraine MCMC traces for likelihoods, parameters, spawning biomass, and recruitment.
导入科尔雷恩的MCMC痕迹似然性，参数，产卵生物量和招聘。


用法----------Usage----------


importMCMC(dir, info="", coda=FALSE, quiet=TRUE, pretty.labels=FALSE,
           l.choose=NULL, p.choose=NULL)



参数----------Arguments----------

参数：dir
directory containing the files "mcmclike.out", "params.pst", "spawbiom.pst" and "recruits.pst".
目录中包含文件的mcmclike.out，params.pst，spawbiom.pst和recruits.pst。


参数：info
optional string containing information to store with MCMC results.
可选的字符串，其中包含的信息存储与MCMC结果。


参数：coda
whether data frames should be coerced to class mcmc using the coda package.
数据框是否应被强制转换为类mcmc使用coda包。


参数：quiet
whether to report progress while parsing files in directory.
是否要汇报工作进度，在解析目录中的文件。


参数：pretty.labels
whether likelihood and parameter columns should be renamed
是否应该改名的可能性和参数列


参数：l.choose
vector of strings, indicating which likelihood components to import, or NULL to import all.
向量的字符串表示的可能性组件进口，或NULL导入所有。


参数：p.choose
vector of strings, indicating which parameters to import, or NULL to import all.
向量的字符串，指示哪些参数导入，或NULL导入所有。


值----------Value----------

A list containing: <table summary="R valueblock"> <tr valign="top"><td>L</td> <td> likelihoods</td></tr> <tr valign="top"><td>P</td> <td> parameters</td></tr> <tr valign="top"><td>B</td> <td> biomass by year</td></tr> <tr valign="top"><td>R</td> <td> recruitment by year</td></tr> </table> as data frames, or mcmc objects if coda=TRUE.
一个列表，其中包含：<table summary="R valueblock"> <tr valign="top"> <TD> L </ TD> <TD>似然</ TD> </ TR> <TR VALIGN =“顶“> <TD> P </ TD> <TD>参数</ TD> </ TR> <tr valign="top"> <TD> B </ TD> <TD>生物质每年</ TD> </ TR> <tr valign="top"> <TD> R </ TD> <TD>年招募</ TD> </ TR> </表>作为数据框，或如果mcmccoda=TRUE对象。


注意----------Note----------

The example dataset xmcmc was generated using importMCMC.
示例数据集xmcmc产生的使用importMCMC，。

The functions ll (package gdata) and head are recommended for browsing MCMC results, e.g. ll(xmcmc); ll(xmcmc$P); head(xmcmc$P).
的功能ll（包gdata）head建议浏览MCMC结果，例如： ll(xmcmc); ll(xmcmc$P); head(xmcmc$P)。


参考文献----------References----------

Hilborn, R., M. Maunder, A. Parma, B. Ernst, J. Payne, and P. Starr. 2003. <CITE>Coleraine: A generalized age-structured stock assessment model.</CITE> User's manual version 2.0. University of Washington Report SAFS-UW-0116. Available at http://fish.washington.edu/research/coleraine/coleraine.pdf.

参见----------See Also----------

read.table, readLines, and scan import any data.
read.table，readLines和scan导入任何数据。

importMCMC and importProj import Coleraine MCMC results.
importMCMC和importProj进口的科尔雷恩MCMC结果。

xmcmc was created using importMCMC.
xmcmc创建使用importMCMC。

scapeMCMC-package gives an overview of the package.
scapeMCMC-package给出了一个概述的包。


实例----------Examples----------


## Not run: [＃不运行：]
dir <- system.file("example", package="scapeMCMC")
xmcmc &lt;- importMCMC(dir)  # or rename and select particular elements:[或重新命名，并选择特定的元素：]
xmcmc <- importMCMC(dir, pretty.labels=TRUE,
                    l.choose=c("CAc","CAs","Survey","Prior","Total"),
                    p.choose=c("R0","Rinit","uinit","cSleft","cSfull",
                               "sSleft","sSfull","logq"))

## End(Not run)[＃（不执行）]

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