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samr.tail.strength(samr)
samr.tail.strength()所属R语言包：samr

                                        Estimate tail strength for a dataset, from a SAM analysis
                                         估计尾强度的数据集，从SAM分析

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Estimate tail strength for a dataset, from a SAM analysis
估计尾强度的数据集，从SAM分析


用法----------Usage----------


samr.tail.strength(samr.obj)



参数----------Arguments----------

参数：samr.obj
Object returned by samr
返回的对象SAMR


值----------Value----------

A list with components <table summary="R valueblock"> <tr valign="top"><td>ts</td> <td> Estimated tail strength. A number less than or equal to 1. Zero means all genes are null; 1 means all genes are differentially expressed.</td></tr></table> , <table summary="R valueblock"> <tr valign="top"><td>se.ts</td> <td> Estimated standard error of tail strength.</td></tr> </table>
列表组件表summary="R valueblock"> <tr valign="top"> <TD>ts</ TD> <TD>估计尾实力。甲数小于或等于1。零意味着所有的基因都为空，1表示所有基因的差异表达。</ TD> </ TR> </ TABLE>，<表summary="R valueblock"> <tr valign="top"> <TD>se.ts </ TD> <TD>尾强度的估计标准误差。</ TD> </ TR> </ TABLE>


（作者）----------Author(s)----------


Jun Li and Balasubrimanian Narasimhan and Robert Tibshirani



参考文献----------References----------

A tail strength measure for assessing the overall significance in a dataset. Submitted.

实例----------Examples----------


#generate some example data[产生一些示例数据]
set.seed(100)
x<-matrix(rnorm(1000*20),ncol=20)
dd<-sample(1:1000,size=100)

u<-matrix(2*rnorm(100),ncol=10,nrow=100)
x[dd,11:20]<-x[dd,11:20]+u

y<-c(rep(1,10),rep(2,10))

data=list(x=x,y=y, geneid=as.character(1:nrow(x)),
genenames=paste("g",as.character(1:nrow(x)),sep=""), logged2=TRUE)

samr.obj<-samr(data,  resp.type="Two class unpaired", nperms=100)

samr.tail.strength(samr.obj)


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