normalize.contrasts(affy)
normalize.contrasts()所属R语言包:affy
Normalize intensities using the contrasts method
标准化强度使用对比的方法
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Scale chip objects in an AffyBatch-class.
在大规模芯片AffyBatch-class对象。
用法----------Usage----------
normalize.AffyBatch.contrasts(abatch,span=2/3, choose.subset=TRUE,
subset.size=5000, verbose=TRUE,
family="symmetric",
type=c("together","pmonly","mmonly","separate"))
参数----------Arguments----------
参数:abatch
an AffyBatch-class object.
AffyBatch-class对象。
参数:span
parameter to be passed to the function loess.
参数被传递给函数loess。
参数:choose.subset
Boolean. Defaults to TRUE
布尔值。 TRUE默认
参数:subset.size
Integer. Number of probesets to use in each subset.
整数。数probesets使用中的每个子集。
参数:verbose
verbosity flag.
冗长的标志。
参数:family
parameter to be passed to the function loess.
参数被传递给函数loess。
参数:type
a string specifying how the normalization should be applied.
一个字符串,指定应如何标准化。
值----------Value----------
An object of the same class as the one passed.
同一类作为一个对象传递。
参见----------See Also----------
maffy.normalize
maffy.normalize
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注:
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