R语言 affy包 normalize-methods()函数中文帮助文档(中英文对照)

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normalize-methods(affy)
normalize-methods()所属R语言包：affy

                                        Normalize Affymetrix Probe Level Data - methods
                                         规范化Affymetrix的探针级数据 - 方法

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Method for normalizing Affymetrix Probe Level Data
标准化Affymetrix的探针水平数据的方法


用法----------Usage----------


normalize.methods(object)
bgcorrect.methods()
upDate.bgcorrect.methods(x)
pmcorrect.methods()
upDate.pmcorrect.methods(x)



参数----------Arguments----------

参数：object
An AffyBatch.
AffyBatch。


参数：x
A character vector that will replace the existing one.
一个特征向量，将取代现有的。


Details

详情----------Details----------

If object is an AffyBatch object, then normalize(object) returns an AffyBatch object with the intensities normalized using the methodology specified by getOption("BioC")$affy$normalize.method. The affy package default is quantiles.
如果object是AffyBatch对象，然后normalize(object)返回一个AffyBatch使用由getOption("BioC")$affy$normalize.method指定的方法归强度的对象。 affy包默认是quantiles。

Other methodologies can be used by specifying them with the method argument. For example to use the invariant set methodology described by Li and Wong (2001) one would type: normalize(object, method="invariantset").
指定method参数，可以使用其他方法。例如使用李和黄（2001）所描述的不变集的方法，一会键入：normalize(object, method="invariantset")。

Further arguments passed by ..., apart from method,  are passed along to the function responsible for the methodology defined by the method argument.
通过进一步论据...，除了method，传递到负责method参数定义的方法的功能。

A character vector of nicknames for the methodologies available is returned by normalize.methods(object)), where object  is an  AffyBatch, or simply by typing normalize.AffyBatch.methods. If the nickname of a method is called "loess", the help page for that specific methodology can be accessed by typing ?normalize.loess.
昵称可用的方法的一个特征向量，则返回normalize.methods(object))，其中objectAffyBatch，或只需键入normalize.AffyBatch.methods的。如果一个方法的绰号叫“黄土”，具体方法的帮助页，可以键入?normalize.loess访问。

For more on the normalization methodologies currently implemented please refer to the vignette "Custom Processing Methods".
对目前实施的规范化方法的更多信息，请参阅“小插曲”自定义处理方法“。

To add your own normalization procedures please refer to the customMethods vignette.
添加您自己的标准化程序请参阅的customMethods插曲。

The functions: bgcorrect.methods, pmcorrect.methods, provide access to internal vectors listing the corresponding capabilities.
功能：bgcorrect.methods，pmcorrect.methods，提供访问内部列出的相应能力的向量。


参见----------See Also----------

AffyBatch-class, normalize.
AffyBatch-class，normalize。


举例----------Examples----------


if (require(affydata)) {
  data(Dilution)
  normalize.methods(Dilution)
  generateExprSet.methods()
  bgcorrect.methods()
  pmcorrect.methods()
}

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