mva.pairs(affy)
mva.pairs()所属R语言包:affy
M vs. A Matrix
中号与一个矩阵
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
A matrix of M vs. A plots is produced. Plots are made on the upper triangle and the IQR of the Ms are displayed in the lower triangle
产生一个M的矩阵与一个图。图上三角四分的女士在较低的三角形显示
用法----------Usage----------
mva.pairs(x, labels=colnames(x), log.it=TRUE,span=2/3,family.loess="gaussian",
digits=3,line.col=2,main="MVA plot",cex=2,...)
参数----------Arguments----------
参数:x
a matrix containing the chip data in the columns.
矩阵列中包含的芯片数据。
参数:labels
the names of the variables.
变量的名称。
参数:log.it
logical. If TRUE, uses log scale.
逻辑。如果TRUE,使用log规模。
参数:span
span to be used for loess fit.
跨度黄土适合使用。
参数:family.loess
"gaussian" or "symmetric" as in loess.
"gaussian"或"symmetric"loess。
参数:digits
number of digits to use in the display of IQR.
使用四分显示的数字号码。
参数:line.col
color of the loess line.
颜色黄土一行。
参数:main
an overall title for the plot.
图的总冠军。
参数:cex
size for text.
文本的大小。
参数:...
graphical parameters can be given as arguments to mva.plot </table>
图形参数可以mva.plot</ TABLE>参数
参见----------See Also----------
pairs
pairs
举例----------Examples----------
x <- matrix(rnorm(4000),1000,4)
x[,1] <- x[,1]^2
dimnames(x) <- list(NULL,c("chip 1","chip 2","chip 3","chip 4"))
mva.pairs(x,log=FALSE,main="example")
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