R语言 affy包 cleancdfname()函数中文帮助文档(中英文对照)

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cleancdfname(affy)
cleancdfname()所属R语言包：affy

                                        Clean Affymetrix's CDF name
                                         清洁Affymetrix公司的民防部队名称

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function converts Affymetrix's names for CDF files to the names used in the annotation package and in all Bioconductor.
此功能转换在注释包Bioconductor在所有使用的名称，Affymetrix公司的CDF文件的名称。


用法----------Usage----------


cleancdfname(cdfname, addcdf = TRUE)



参数----------Arguments----------

参数：cdfname
A character denoting Affymetrix'x CDF file name  
一个character汉语表Affymetrixx CDF文件名称


参数：addcdf
A logical. If TRUE it adds the string "cdf" at the end of the cleaned CDF name. This is used to name the cdfenvs packages.
Alogical。如果TRUE它增加了清理民防名称字符串“CDF”。这是用来命名cdfenvs包。


Details

详情----------Details----------

This function takes a CDF filename obtained from an Affymetrix file (from a CEL file for example) and convert it to a convention of ours: all small caps and only alphanumeric characters. The details of the rule can be seen in the code. We observed exceptions that made us create a set of special cases for mapping CEL to CDF. The object mapCdfName holds information about these cases. It is a data.frame of three elements: the  first is the name as found in the CDF file, the second the name in the CEL file and the third the name in Bioconductor. mapCdfName can be loaded using data(mapCdfName).
这个函数需要一个CDF文件名获得Affymetrix公司的文件（例如从CEL文件），并把它转换到我们的公约“：所有的小帽子，只有字母数字字符。代码可以看出，在规则的细节。我们观察到的异常，使我们建立了一套特殊情况下，CEL映射到民防部队。对象mapCdfName持有有关这些情况的信息。这是data.frame的三个要素：首先是名称，如发现在CDF文件，在为CEL文件的名称第二和第三Bioconductor名称。 mapCdfName使用data(mapCdfName)可以装载。


值----------Value----------

A character
一个character


举例----------Examples----------


cdf.tags <- c("HG_U95Av2", "HG-133A")
for (i in cdf.tags)
  cat(i, "becomes", cleancdfname(i), "\n")

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