R语言 affypdnn包 find.params.pdnn()函数中文帮助文档(中英文对照)

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find.params.pdnn(affypdnn)
find.params.pdnn()所属R语言包：affypdnn

                                         A function to find the experiment specific PDNN parameters
                                         找到实验具体PDNN参数的函数

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A function to find the paramaters specific to the chips in an AffyBatch object.
具体到芯片在AffyBatch对象的paramaters一个功能。


用法----------Usage----------


find.params.pdnn(abatch, params.chiptype, optim.method = "BFGS", verbose = TRUE, give.warnings=TRUE)



参数----------Arguments----------

参数：abatch
an instance of AffyBatch-class.  
AffyBatch-class实例。


参数：params.chiptype
chip-type specific parameters (see details)
芯片的具体参数（见详情）


参数：optim.method
method for the optimization function optim. When FALSE, a steepest-descent method of our own is used.
优化功能optim方法。当FALSE，我们自己的最速下降法的使用。


参数：verbose
verbosity (TRUE or FALSE)  
冗长（TRUE或FALSE）


参数：give.warnings
report probeset IDs in the abatch that could not be found in the params.chiptype
报告不能abatch的params.chiptype probeset标识


Details

详情----------Details----------

This function fits PDNN parameters that are specific to experimental values. The parameters common to all the chips of a certain type are returned by the function pdnn.params.chiptype. If NULL, the parameter files included in the package will be used whenever possible...
此功能适合PDNN具体实验值的参数。共同所有的某种类型的芯片功能pdnn.params.chiptype返回的参数。如果NULL，包中包含的参数文件将尽可能使用...


值----------Value----------

A list of
一列


参数：lambda
The lambda's
lambda的


参数：Bs
The B's
B的


参数：Ns
The N's
N的


参数：Fs
The F's
在F


参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

pdnn.params.chiptype, generateExprVal.method.pdnn
pdnn.params.chiptype，generateExprVal.method.pdnn


举例----------Examples----------


## load a chip-specific parameter file[＃加载芯片的具体参数文件。]
## (as returned by the function pdnn.params.chiptype)[＃（由功能pdnn.params.chiptype返回）]
data(hgu95av2.pdnn.params)

## load experimental data[＃加载实验数据]
library(affydata)
data(Dilution)

## one CEL to go faster[＃一CEL走得更快]
afbatch <- Dilution[, 1]
params <- find.params.pdnn(afbatch, hgu95av2.pdnn.params, optim.method =
FALSE, give.warnings=FALSE)


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