R语言 RVtests包 PLS()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

PLS(RVtests)
PLS()所属R语言包：RVtests

                                        Partial Least Squares Regression for RV tests
                                         偏最小二乘回归RV测试

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Use PLS components for testing rare variants association with disease traits.
使用PLS部件测试罕见的变异与疾病特征。


用法----------Usage----------


PLS(x, y, scale = FALSE, ncomp, varpercent, npermutation = 100, npermutation.max, min.nonsignificant.counts)



参数----------Arguments----------

参数：x
Genotype matrix
基因型矩阵


参数：y
Phenotype vector
表型矢量


参数：scale
If TRUE, scale x and y.
如果TRUE，规模化的X和Y。


参数：ncomp
Number of components, which could be a vector containing a set of numbers.
分量的数目，这可能是一个向量，包含了一组数字。


参数：varpercent
Explained variance percentage
解释方差百分比


参数：npermutation
Number of permutation, if less than 1, the permutation will not be run.
编号的置换，如果小于1，置换不会运行。


参数：npermutation.max
Maximum permutation, if missing, equal to npermutation.
最大排列，如果缺失，等于向npermutation。


参数：min.nonsignificant.counts
Minimum nonsignificant counts, if missing, equal to 10.
最小无显着性计数，如果缺失，等于10。


值----------Value----------


参数：score
Correlation between y and y_est
y与y_est的相关性


参数：nonsignificant.counts
Counts of permuted data that have a higher score than unpermuted data.
排列的数据的有较高的分数比unpermuted数据的计数。


参数：pvalue.empirical
Empirical pvalue via permutation
通过排列的实证P值


参数：pvalue.nominal
Theoretical pvalue, not available now.
理论P值，而不是现在。


参数：total.permutation
Total permutation
总排列


参数：ncomp.varp
Number of components required for specified variance percentage
指定的差异百分比所需的元件数量


（作者）----------Author(s)----------


C. Xu



参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

PCR, SPLS
PCR, SPLS

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注：
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