PCR(RVtests)
PCR()所属R语言包:RVtests
Principal Components Regression for RV tests
主成分回归RV测试
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Use principal components for testing rare variants association with disease traits.
罕见的变异与疾病特征测试使用的主要组成部分。
用法----------Usage----------
PCR(x, y, scale = FALSE, ncomp, varpercent, npermutation = 100, npermutation.max, min.nonsignificant.counts)
参数----------Arguments----------
参数:x
Genotype matrix
基因型矩阵
参数:y
Phenotype vector
表型矢量
参数:scale
If TRUE, scale x and y.
如果TRUE,规模化的X和Y。
参数:ncomp
Number of components, which could be a vector containing a set of numbers.
分量的数目,这可能是一个向量,包含了一组数字。
参数:varpercent
Explained variance percentage
解释方差百分比
参数:npermutation
Number of permutation, if less than 1, the permutation will not be run.
编号的置换,如果小于1,置换不会运行。
参数:npermutation.max
Maximum permutation, if missing, equal to npermutation.
最大排列,如果缺失,等于向npermutation。
参数:min.nonsignificant.counts
Minimum nonsignificant counts, if missing, equal to 10.
最小无显着性计数,如果缺失,等于10。
值----------Value----------
参数:score
Correlation between y and y_est
y与y_est的相关性
参数:nonsignificant.counts
Counts of permuted data that have a higher score than unpermuted data.
排列的数据的有较高的分数比unpermuted数据的计数。
参数:pvalue.empirical
Empirical pvalue via permutation
通过排列的实证P值
参数:pvalue.nominal
Theoretical pvalue, not available now.
理论P值,而不是现在。
参数:total.permutation
Total permutation
总排列
参数:ncomp.varp
Number of components required for specified variance percentage
指定的差异百分比所需的元件数量
(作者)----------Author(s)----------
C. Xu
参考文献----------References----------
参见----------See Also----------
PLS, RR
PLS, RR
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注:
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