plotILM(affyILM)
plotILM()所属R语言包:affyILM
plotILM
plotILM
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Illustrate the Langmuir Isotherm for selected probe set.
选定的探针组,说明Langmuir吸附等温。
用法----------Usage----------
plotILM(object,y,z,...)
参数----------Arguments----------
参数:object
An object of type ILM
对象的类型ILM
参数:y
A probe set
探针集
参数:z
The name of a sample
样品名称
参数:...
Graphical parameters can be given as arguments to par
图形参数可以给出par参数
Details
详情----------Details----------
plotIntens plots one graph for each CEL-file. Note that it is only possible to plot one probe set at a time (if y (or z) is a vector, only the first value is used). If y=NULL or z=NULL, there is no output. Optional plot.error argument (numeric) can be used to define the illustration of the variability. plot.error=1 computes the error on the log scale. plot.error=2 (default value) computes the error on the concentrations. plot.error=3 computes the error on the concentrations, for 2 intervals. Note that error curves can only be plotted if concentration is higher than error (negative concentration does not exist!).
plotIntens绘制每个为CEL文件的图形之一。请注意,它是唯一可能在一段时间(如果Y(或Z)是一个向量,只有第一个值)绘制一个探针组。 Y = NULL或Z = NULL,如果没有输出。可选plot.error参数(数字)可以用来定义变异的插图。 plot.error = 1计算错误log上规模。 plot.error = 2(默认值),计算错误的浓度。 plot.error = 3计算错误的浓度,2间隔。请注意,误差曲线只能绘制,如果浓度高于错误(负的浓度不存在!)。
作者(S)----------Author(s)----------
Myriam Kroll, Fabrice Berger and Enrico Carlon
参见----------See Also----------
ILM,plotIntens
ILM,plotIntens
举例----------Examples----------
path <- system.file("rawData", "FusionSDK_HG-Focus", "HG-Focus", "2.Calvin",
package="AffymetrixDataTestFiles")
file1 <- file.path(path,"HG-Focus-1-121502.CEL")
file2 <- file.path(path,"HG-Focus-2-121502.CEL")
result2 <- ilm(c(file1,file2))
## plot output[#图输出的]
plotILM(result2,y="203561_at",z="HG-Focus-2-121502.CEL")
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