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R语言 affyILM包 plotILM()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 11:16:39 | 显示全部楼层 |阅读模式
plotILM(affyILM)
plotILM()所属R语言包:affyILM

                                         plotILM
                                         plotILM

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Illustrate the Langmuir Isotherm for selected probe set.
选定的探针组,说明Langmuir吸附等温。


用法----------Usage----------


plotILM(object,y,z,...)



参数----------Arguments----------

参数:object
An object of type ILM
对象的类型ILM


参数:y
A probe set
探针集


参数:z
The name of a sample
样品名称


参数:...
Graphical parameters can be given as arguments to par
图形参数可以给出par参数


Details

详情----------Details----------

plotIntens plots one graph for each CEL-file. Note that it is only possible to plot one probe set at a time (if y (or z) is a vector, only the first value is used). If y=NULL or z=NULL, there is no output.  Optional plot.error argument (numeric) can be used to define the illustration of the variability. plot.error=1 computes the error on the log scale. plot.error=2 (default value) computes the error on the concentrations. plot.error=3 computes the error on the concentrations, for 2 intervals. Note that error curves can only be plotted if concentration is higher than error (negative concentration does not exist!).
plotIntens绘制每个为CEL文件的图形之一。请注意,它是唯一可能在一段时间(如果Y(或Z)是一个向量,只有第一个值)绘制一个探针组。 Y = NULL或Z = NULL,如果没有输出。可选plot.error参数(数字)可以用来定义变异的插图。 plot.error = 1计算错误log上规模。 plot.error = 2(默认值),计算错误的浓度。 plot.error = 3计算错误的浓度,2间隔。请注意,误差曲线只能绘制,如果浓度高于错误(负的浓度不存在!)。


作者(S)----------Author(s)----------


Myriam Kroll, Fabrice Berger and Enrico Carlon



参见----------See Also----------

ILM,plotIntens
ILM,plotIntens


举例----------Examples----------


path <- system.file("rawData", "FusionSDK_HG-Focus", "HG-Focus", "2.Calvin",
    package="AffymetrixDataTestFiles")
file1 <- file.path(path,"HG-Focus-1-121502.CEL")
file2 <- file.path(path,"HG-Focus-2-121502.CEL")
result2 <- ilm(c(file1,file2))
## plot output[#图输出的]
plotILM(result2,y="203561_at",z="HG-Focus-2-121502.CEL")

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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