pre.process(AffyExpress)
pre.process()所属R语言包:AffyExpress
Data Preprocessing
数据预处理
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function converts an 'AffyBatch' into an 'ExpressionSet' using either RMA or GCRMA methods
此功能转换成ExpressionSet“AffyBatch使用RMA或GCRMA的方法
用法----------Usage----------
pre.process(method, raw, plot=FALSE, output=FALSE)
参数----------Arguments----------
参数:method
either "rma" or "gcrma"
“RMA”或“gcrma的”
参数:raw
an 'AffyBatch'
AffyBatch“
参数:plot
if plot = TRUE, it will plot gene expression for each chip
如果图= TRUE时,将每个芯片绘制基因表达
参数:output
if output = TRUE, it will output 'ExpressionSet' to the current directory
如果输出= TRUE时,将输出到当前目录“ExpressionSet
值----------Value----------
an 'ExpressionSet'
ExpressionSet“
作者(S)----------Author(s)----------
Xiwei Wu <a href="mailto:xwu@coh.org">xwu@coh.org</a>, Xuejun Arthur Li <a href="mailto:xueli@coh.org">xueli@coh.org</a>
举例----------Examples----------
data(testData)
normaldata<-pre.process("rma",testData)
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