R语言 AffyExpress包 AffyQA()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

AffyQA(AffyExpress)
AffyQA()所属R语言包：AffyExpress

                                         Microarray quality control and assessment
                                         芯片质量控制和评估

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Create quality control report in an HTML file that contains a set of assessment plots, including Affymetrix recommended quality assessment, RNA quality assessment, sample quality assessment, quality diagnostic using PLM (pseudo-chip images  and NUSE and RLE plots) in your current working directory.
创建一个HTML文件，它包含了一套评估图，包括Affymetrix公司推荐的质量评估，RNA的质量评估，样品的质量评估，质量诊断，使用PLM在当前工作目录（伪芯片的图像和怒色和RLE图）质量控制报告。


用法----------Usage----------


AffyQA(parameters, raw, Output="AffyQA.html")



参数----------Arguments----------

参数：parameters
a list of variables
变量列表


参数：raw
an 'AffyBatch'  
AffyBatch“


参数：Output
name of the output file   
输出文件的名称


值----------Value----------

This function only create an html file
这个函数只创建一个HTML文件


作者（S）----------Author(s)----------


Xiwei Wu <a href="mailto:xwu@coh.org">xwu@coh.org</a>, Xuejun Arthur Li <a href="mailto:xueli@coh.org">xueli@coh.org</a>



举例----------Examples----------


## Not run: [＃无法运行：]
data(testData)
AffyQA(parameters=c("group", "gender"), testData)

## End(Not run)[＃结束（不运行）]

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。