getUniqueLL(affycoretools)
getUniqueLL()所属R语言包:affycoretools
Subset a Vector of Probesets
一个子集向量的Probesets
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function will take a vector of Affy IDs and return a vector of Entrez IDs that have replicated IDs removed. The resulting vector will still have the corresponding Affy IDs appended as names, which is important for some functions.
此功能将的Affy标识向量,并返回一个Entrez的标识的ID删除已复制的向量。由此产生的向量仍然有相应的Affy附加标识的名字,这是非常重要的部分功能。
用法----------Usage----------
getUniqueLL(probes, annot)
参数----------Arguments----------
参数:probes
A vector of probe IDs
一个探针身份证向量
参数:annot
The annotation package for the chip used
标注所使用的芯片包
Details
详情----------Details----------
Subsetting a set of Affy IDs to unique Entrez Gene IDs is a common thing to do prior to doing a hypergeometric test. Functions such as hyperGTest can use un-named vectors of Entrez IDs (e.g., unique(getLL(probeIDs, annot))), but there is some functionality that requires the Entrez Gene IDs to be in a named vector, with the names being the associated Probeset IDs.
子集的Affy ID的一套独特的Entrez基因标识,是常见的事,做事先做了超几何测试。功能,如hyperGTest可以使用未命名的向量Entrez的标识(例如,独特的(getLL(probeIDs,annot))),但有一些功能需要Entrez基因标识是在一个名为向量,名称相关Probeset ID的。
As an example, hyperGoutput will only work correctly if the input Entrez ID vector is named with the associated Probeset IDs.
作为一个例子,hyperGoutput只会正常工作Entrez的编号,如果输入向量与相关Probeset ID的命名。
值----------Value----------
A named vector of unique Entrez IDs
一个独特的Entrez的ID命名为向量
作者(S)----------Author(s)----------
James W. MacDonald <jmacdon@med.umich.edu>
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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