R语言 rtfbs包 read.ms()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

read.ms(rtfbs)
read.ms()所属R语言包：rtfbs

                                        Reading in sequences from file
                                         从文件中读取的序列

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Read Multiple Sequences from a FASTA file.
从FASTA文件的多序列比对。


用法----------Usage----------


  read.ms(filename, pointer.only = FALSE)



参数----------Arguments----------

参数：filename
The name of the input file containing the sequences. File should be in FASTA format.
包含的序列的输入文件的名称。应该是FASTA格式文件。


参数：pointer.only
If TRUE, sequences within the MS will be stored by reference as external pointers to objects created by C code, rather than directly in R memory.  This improves performance and may be necessary for large files, but reduces functionality.
如果TRUE，在MS序列将存储作为参考外部用C代码中创建的对象的指针，而不是直接在R存储器。这提高了性能和大型文件可能是必要的，但会降低功能性。


值----------Value----------

MS object containing sequences read from file
从文件中读取MS对象，其中包含序列


参见----------See Also----------

ms for further description of MS objects and pointer.only option.
ms为进一步说明MS对象和pointer.only的选项。


实例----------Examples----------


require("rtfbs")
exampleArchive <- system.file("extdata", "NRSF.zip", package="rtfbs")
seqFile <- "input.fas"
unzip(exampleArchive, seqFile)
# Read in FASTA file "input.fas" from the examples into an [阅读在FASTA的文件“input.fas”中的例子成]
#   MS (multiple sequences) object[多个序列（MS）对象]
seqs <- read.ms(seqFile)
# Print the number of sequences in the MS object and whether[MS中的对象，以及是否打印的序列数]
#   stored in C or R[存储在C或R]
print(seqs)

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。