R语言 affycomp包 assessSpikeIn()函数中文帮助文档(中英文对照)

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assessSpikeIn(affycomp)
assessSpikeIn()所属R语言包：affycomp

                                        Assessment functions for Spike In Data
                                         穗评估功能，在数据

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

These functions are assessment functions. Each takes an ExpressionSet and returns a list with necessary
这些功能是评估职能。每个ExpressionSet并返回必要的列表


用法----------Usage----------


assessSpikeIn(s,method.name=NULL,verbose=TRUE)

assessMA(exprset,method.name=NULL)
assessSignal(exprset,method.name=NULL)
assessFC(exprset,method.name=NULL)
assessFC2(exprset,method.name=NULL)



参数----------Arguments----------

参数：s
An ExpressionSet containing  expression measures for Affymetrix's spike-in experiment.
一个ExpressionSet含有表达Affymetrix公司的穗在实验措施。


参数：exprset
An ExpressionSet containing  expression measures for Affymetrix's spike-in experiment.
一个ExpressionSet含有表达Affymetrix公司的穗在实验措施。


参数：method.name
Name of expression measure being assessed.
表达措施的名称被评估。


参数：verbose
logical. If TRUE show messages.
逻辑。如果TRUE显示的消息。


Details

详情----------Details----------

assessMA performs the assessment for the MA-plot (Figure 1), assessSignal performs the assessment for signal detection plot (Figure 4a), assessFC performs assessments used by fold-change related  plots (Figures 5a, 6a, 6b). assessFC2 is for the ROC for genes with nominal fold changes of 2 (Figure 5b). assessSpikeIn is a wrapper for all these and returns a list
assessMA执行主图的评估（图1），assessSignal执行信号检测图的评估（图4a），assessFC执行相关图倍，改变使用评估（图5A，6A，6B）。 assessFC2是中华民国面值2倍的变化（图5b）基因。 assessSpikeIn是所有这些的包装，并返回一个列表


值----------Value----------

Lists with the necessary information to make the Figures.
必要的信息，使数字列表。


作者（S）----------Author(s)----------


Rafael A. Irizarry

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