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R语言 AffyCompatible包 readXml()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 11:09:37 | 显示全部楼层 |阅读模式
readXml(AffyCompatible)
readXml()所属R语言包:AffyCompatible

                                         (Advanced) Read XML files of Affymetrix sample attriubtes or annotation
                                         (高级)阅读Affymetrix公司的样品attriubtes或批注的XML文件

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This functions reads the content of Affymetrix DTT (MAGE) or ARR sample files, or AffxNetAffxAnnotFile array annotation files, return an internal representation of the underlying XML. The return value can be used with xclass to rapidly create R objects representing deeply nested nodes of the document. The return value can also be used with xpathApply in the XML package for access to character-based representation of the data.
此功能读取Affymetrix公司的DTT(法师)或ARR的样本文件,或AffxNetAffxAnnotFile阵列注释文件的内容,返回一个底层的XML内部表示。用xclass返回值可以用来快速创建R对象代表文档的深层嵌套节点。返回值也可以用xpathApply访问基于字符的数据表示为XML包。


用法----------Usage----------


readXml(fl, ...)



参数----------Arguments----------

参数:fl
A length-1 character vector giving the full path to the file to be parsed.
要解析一个长度为1个字符矢量文件的完整路径。


参数:...
Additional arguments, passed to xmlTreeParse.
额外的参数,通过xmlTreeParse。


值----------Value----------

An object of class XMLInternalDocument.
对象类XMLInternalDocument。


作者(S)----------Author(s)----------


Martin Morgan



参见----------See Also----------

The vignettes "Retrieving MAGE and ARR sample attributes" and "Annotation retrieval with NetAffxResource" for detailed illustration of use.
“护身符”检索的法师和房租样本属性和使用的详细说明“与NetAffxResource注释检索”。

xclass for instantiating objects from xpath queries.
xclassXPath查询对象实例。


举例----------Examples----------


mageDir <- system.file("extdata", "DTT", package="AffyCompatible")
mageFiles <- list.files(mageDir, full=TRUE)
xml <- readXml(mageFiles[[1]])
xclass(xml, "//MeasuredBioAssay")[[1]]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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