gcc.dist(rsgcc)
gcc.dist()所属R语言包：rsgcc
compute distance matrix for hierarchical clustering
计算距离矩阵层次聚类
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function computes the distance between the rows of a data matrix with the specified distance method.
该函数计算与指定的距离的方法的一个数据矩阵的行之间的距离。
用法----------Usage----------
gcc.dist(x,
cpus = 1,
cormethod = c("GCC", "PCC", "SCC", "KCC", "BiWt"),
distancemethod = c("Raw", "Abs", "Sqr"))
参数----------Arguments----------
参数：x
a data matrix containing numeric variables, which is the same as the "GEMatrix" defined in the cor.matrix function.
含有数值变量的一个数据矩阵，这是相同的“GEMatrix”定义在cor.matrix函数。
参数：cpus
the number of cpus used for computation.
的CPU的数目，用于计算。
参数：cormethod
a character string indicating the correlation method to be used.
一个字符串，表示要使用的相关方法。
参数：distancemethod
a character string indicating the distance method to be used. Currently, three distance methods are available, include: "Raw" (1-cor)", "Abs" (1-|cor|), and "Sqr" (1-|cor|^2).
一个字符的字符串，指示要使用的距离的方法。目前，有三种不同的距离的方法，包括：“原始”（1-COR）“，”ABS“（1 - | COR |），”SQR“（1 - 肺心病| ^ 2）。
值----------Value----------
A list with the following components:
以下组件列表：
参数：dist
a data matrix containing the distances between different genes.
含有不同基因之间的距离的一个数据矩阵。
参数：pairmatrix
a data matrix including the correlation between different genes.
包括不同基因之间的相关性的数据矩阵。
（作者）----------Author(s)----------
Chuang Ma, Xiangfeng Wang
参见----------See Also----------
cor.matrix, gcc.hclust, gcc.tsheatmap.
cor.matrix，gcc.hclust，gcc.tsheatmap。
实例----------Examples----------
data(rsgcc)
x <- rnaseq[1:10,]
gcc.dist(x, cormethod = "GCC", distancemethod = "Raw", cpus = 1)
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注：
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发表于 2012-9-28 21:53:45
