R语言 rsgcc包 gcc.corfinal()函数中文帮助文档(中英文对照)

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gcc.corfinal(rsgcc)
gcc.corfinal()所属R语言包：rsgcc

                                         get the final correlaiton and p-value of Gini method
                                         基尼系数的方法，得到最终的correlaiton和p值

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Compare two correlations produced by GCC method for a gene pair, and choose one as the final output of GCC method.
比较两个相关基因对GCC方法，并选择一个作为最终输出的GCC方法。


用法----------Usage----------


        gcc.corfinal(gcccor)



参数----------Arguments----------

参数：gcccor
a list output by cor.pair function for GCC method.  
一个列表输出GCC方法cor.pair功能。


Details

详细信息----------Details----------

If the p-value is "NA", the correlation with absolute maximum value is selected; otherwise, the correlation with lower p-value is chosen.
如果p-值是“NA”，绝对最大相关值被选择，否则，选择的相关性较低的p-值。


值----------Value----------


参数：gcc.fcor
the final correlation of GCC.
最终海湾合作委员会的关系。


参数：gcc.fpavlue
the final pvalue of correlation.
最后的P值的相关性。


（作者）----------Author(s)----------



Chuang Ma, Xiangfeng Wang




参见----------See Also----------

onegcc, cor.pair.
onegcc，cor.pair。


实例----------Examples----------


   data(rsgcc)
   x <- rnaseq[1:4,]

   #compute correlation between 1th and 4th genes[计算第1和第4个基因之间的相互关系]
   #significance level of the computed correlation [的显着性水平的计算的相关]
   #is calcuated with 200 permutation tests.[是calcuated 200排列测试。]
   corpair <- cor.pair(c(1,4), GEMatrix = x, rowORcol = "row",
                       cormethod = "GCC", pernum = 200,
                       sigmethod = "two.sided")

   #get the final correlation and p-value of GCC method [GCC方法得到最终的相关性和p-值]
   gcc.corfinal(corpair)  


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