readChp(affxparser)
readChp()所属R语言包:affxparser
A function to read Affymetrix CHP files
一个函数来读取Affymetrix公司热电联产文件
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function will parse any type of CHP file and return the results in a list. The contents of the list will depend on the type of CHP file that is parsed and readers are referred to Affymetrix documentation of what should be there, and how to interpret it.
此函数将解析任何CHP的文件类型列表中,并返回结果。列表中的内容将取决于对热电联产的文件解析和Affymetrix公司应该有什么文件,以及如何解释它被称为读者的类型。
用法----------Usage----------
readChp(filename, withQuant = TRUE)
参数----------Arguments----------
参数:filename
The name of the CHP file to read.
卫生防护中心文件名称改为。
参数:withQuant
A boolean value, currently largely unused.
一个布尔值,目前大部分闲置。
Details
详情----------Details----------
This is an interface to the Affymetrix Fusion SDK. The Affymetrix documentation should be consulted for explicit details.
这是Affymetrix公司融合SDK的接口。 Affymetrix公司应明确的细节谘询文件。
值----------Value----------
A list is returned. The contents of the list depend on the type of CHP file that was read. Users may want to translate the different outputs into specific containers.
返回一个列表。列表的内容依赖于卫生防护中心的文件,读的类型。用户可能需要将其转化为特定的容器不同的输出。
故障排除----------Troubleshooting----------
It is considered a bug if the file contains information not accessible by this function, please report it.
它被认为是一个错误,如果该文件包含此功能无法访问的信息,请报告。
作者(S)----------Author(s)----------
R. Gentleman
参见----------See Also----------
readCel
readCel
举例----------Examples----------
if (require("AffymetrixDataTestFiles")) {
path <- system.file("rawData", package="AffymetrixDataTestFiles")
files <- findFiles(pattern="[.](chp|CHP)$", path=path,
recursive=TRUE, firstOnly=FALSE)
s1 = readChp(files[1])
length(s1)
names(s1)
names(s1[[7]])
}
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注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
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