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R语言 adSplit包 randomDiana2means()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 11:04:45 | 显示全部楼层 |阅读模式
randomDiana2means(adSplit)
randomDiana2means()所属R语言包:adSplit

                                        Generate null-distributions of DLD-scores
                                         生成空分布DLD分数

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Draws a number of random sets of probe-sets consisting of the needed size and applies diana2means to compute DLD scores.
绘制一个随机集所需的大小组成的探针集的数量,并适用于diana2means计算DLD分数。


用法----------Usage----------


randomDiana2means(nprobes, data, chip, ndraws = 10000,
                  ngenes = 50, ignore.genes = 5)



参数----------Arguments----------

参数:nprobes
the size of gene sets.
基因组的大小。


参数:data
a matrix of expression data, rows correspond to genes, columns to samples.
表达数据矩阵,行对应的基因,列样品。


参数:chip
the name of the used chip.
所使用的芯片的名称。


参数:ndraws
the number of DLD scores computed.
DLD分数计算。


参数:ngenes
the number of genes used to compute DLD scores (passed to diana2means).
用来计算DLD分数(通过diana2means)的基因数目。


参数:ignore.genes
the number of best scoring genes to be ignored when computing DLD scores (passed to diana2means)  
最佳得分的基因数目计算DLD分数时被忽略(diana2means通过)


Details

详情----------Details----------

This function uses drawRandomPS to draw ndraws gene sets. On these it applies diana2means to determine a null-distribution of DLD-scores.
此功能使用drawRandomPS画ndraws基因集。它适用于对这些diana2means确定的DLD分数分布的空。


值----------Value----------

A vector of DLD-scores.  
DLD分数向量。


作者(S)----------Author(s)----------


Joern Toedling, Claudio Lottaz



参见----------See Also----------

drawRandomPS, diana2means
drawRandomPS,diana2means


举例----------Examples----------


# prepare data[准备数据]
library(vsn)
library(golubEsets)
data(Golub_Merge)

# generate DLD scores[生成DLD分数]
scores <- randomDiana2means(20, exprs(Golub_Merge), "hu6800", ndraws = 500)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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