R语言 rseedcalc包 stack2()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

stack2(rseedcalc)
stack2()所属R语言包：rseedcalc

                                        Estimating presence of stacked genes
                                         估计堆叠的基因

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Assuming qualitative tests are performed on n pools of m seeds, estimate the percent of seeds with single  genetic traits and the percentage of seeds with stacked genetic traits.
假设在n个m的种子进行定性的测试，估计％的种子与单基因性状的百分比与堆叠的遗传性状的种子。


用法----------Usage----------


stack2(n, m, nA, nB, nAB, existAB="Yes", fpr=0, fnr=0, check=TRUE)
stack3(n, m, nA, nB, nC, nAB, nAC, nBC, nABC,
       existAB="Yes", existAC="Yes", existBC="Yes", existABC="Yes",
       fpr=0, fnr=0, check=TRUE)
stack2Excel(...)
stack3Excel(...)




参数----------Arguments----------

参数：n
the number of pools
池的数量


参数：m
the number of seeds in each pool
在每个池中的种子数量


参数：nA
the number of positive pools for event A only
事件A只有积极池的数量


参数：nB
the number of positive pools for event B only
事件B的积极池


参数：nAB
the number of positive pools for both A and B
A和B两者的数目正池的


参数：nC
the number of positive pools for event C only  
事件的数量正池C只


参数：nAC
the number of positive pools for both A and C
A和C的数量正池


参数：nBC
the number of positive pools for both B and C
B和C的数目正池的


参数：nABC
the number of positive pools for both A and B and C
A和B和C的数目正池的


参数：existAB
do seeds with a stacked event 'AB' exist?
做种子与一个堆叠事件AB存在呢？


参数：existAC
do seeds with a stacked event 'AC' exist?
做种子的堆叠事件“AC”存在吗？


参数：existBC
do seeds with a stacked event 'BC' exist?
做种子与堆叠的事件BC存在？


参数：existABC
do seeds with a stacked event 'ABC' exist?
做种子与堆叠的事件ABC存在？


参数：fpr
false positive rate (proportion) for detecting GM events
转基因事件检测的假阳性率（比例）


参数：fnr
false negative rate (proportion) for detecting GM events
假阴性率（比重）检测转基因事件


参数：check
Should simple checks be performed?  Defaults to TRUE
如果进行简单的检查吗？默认为true


参数：...
Other arguments passed
其他参数传递


Details

详细信息----------Details----------

The 'stack2Excel' and 'stack3Excel' functions are simple wrappers that are intended to be called from Excel and should not issue any warnings.
“stack2Excel和stack3Excel”的功能是简单的包装，被称为从Excel，应该不会发出任何警告。


值----------Value----------

A data frame with the estimated proportion of seeds for each event, the observed and expected number of positive pools, and whether or not each event can exist.
一种数据框与估计比例为每个事件的种子，观察到的和预期数的正池，并且不是每个事件是否可以存在。


（作者）----------Author(s)----------


Kevin Wright, Jean-Louis Laffont



实例----------Examples----------


stack2(10, 300, 0, 1, 2)
stack3(20,150, 2,2,2,2,2,2,3, existAB="no", fnr=.02, fpr=.02)

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