Write bedGraph format tracks for UCSC genome browser
写bedGraph UCSC基因组浏览器格式轨道
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Generate bedGraph format files for the UCSC genome browser. This function will write the bedGraph files associated with a aGFFcalc object. There will be either one or two files (default two) representing the raw data and the calculated data (which is output as -log10(val) for visualization purposes for EACH sample).
UCSC基因组浏览器产生bedGraph格式的文件。此功能会写的bedGraph与aGFFcalc对象关联的文件。会有一个或两个文件(默认两个)代表的原始数据和计算的数据(这是输出作为LOG10(VAL),每个样品的可视化的目的)。
用法----------Usage----------
write.bedGraph(x, raw = TRUE, vals = TRUE, directory = ".")
参数----------Arguments----------
参数:x
An ACMESet or ACMECalcSet object
一个ACMESet或ACMECalcSet对象
参数:raw
Boolean. Create a file for the raw data?
布尔值。创建一个原始数据文件吗?
参数:vals
Boolean. Create a file for the calculated p-values?
布尔值。创建一个计算p值的文件?
参数:directory
Give a directory for storing the files
给一个目录用于存储文件