read.resultsGFF(ACME)
read.resultsGFF()所属R语言包：ACME
Read Nimblegen GFF files
阅读的NimbleGen GFF文件
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
A GFF format file is a quite flexible format for storing genomic data. Nimblegen uses these format files as one format for making chip-chip data available. This function reads these files, one per experiment and creates a resulting aGFF-class object.
GFF格式的文件是一个相当灵活的格式，用于存储基因数据。 NimbleGen的使用使芯片的芯片数据格式，这些格式的文件。该函数读取这些文件，每个实验和创造导致aGFF类对象。
用法----------Usage----------
read.resultsGFF(fnames, path = ".", samples = NULL, notes = NULL, skip = 0, sep = "\t", quote = "\"", ...)
参数----------Arguments----------
参数：fnames
A vector of filenames
一个文件名的向量
参数：path
The path to the filenames
文件名的路径
参数：samples
A data.frame containing sample information, one row per sample, in the same order as the files in fnames
数据框包含示例的信息，每一个样本行以相同的顺序，作为在fnames的文件
参数：notes
A character vector for notes–not currently stored
注意到目前没有存储的一个特征向量
参数：skip
Number of lines to skip if the file contains a header
跳过的行数，如果该文件包含一个头
参数：sep
The field separator–should be a tab character for gff files, but can be set if necessary.
字段分隔符应该是GFF文件的制表符，但如有必要，可以设置。
参数：quote
The text quote character–again not used for gff file, typically
引号字符的文本再次GFF文件，通常不用于
参数：...
...
...
Details
详情----------Details----------
The output is an ACMESet object.
输出是ACMESet对象。
值----------Value----------
A single ACMESet object.
单一ACMESet对象。
作者（S）----------Author(s)----------
Sean Davis <sdavis2@mail.nih.gov>
参考文献----------References----------
<h3>See Also</h3>
举例----------Examples----------
datdir <- system.file('extdata',package='ACME')
fnames <- dir(datdir)
example.agff <- read.resultsGFF(fnames,path=datdir)
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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。
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发表于 2012-2-25 11:02:44
