mergeFunc(aCGH)
mergeFunc()所属R语言包:aCGH
Funtion to merge states based on their state means
funtion以合并各国根据其状态是指
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
mergeFunc takes the output of hmm.run.func (or find.hmm.states) with a particular model selection criterion and iteratively merges the states with means closer than a supplied threshold. mergeHmmStates is a frontend for mergeFunc using aCGH object.
mergeFunc需要的hmm.run.func(或find.hmm.states)的输出与一个特定的模型选择标准,并反复合并的方式提供的阈值接近美国。 mergeHmmStates是mergeFunc用aCGH对象的前端。
用法----------Usage----------
mergeHmmStates(aCGH.obj, model.use = 1, minDiff = 0.25)
mergeFunc(statesres, minDiff = 0.1)
参数----------Arguments----------
参数:aCGH.obj
Object of class aCGH.
对象类aCGH。
参数:statesres
the sublist of the states.hmm list output from find.hmm.states for a given model selection crterion
find.hmm.states一个给定的模式选择crterion的states.hmm列表输出的子列表
参数:minDiff
The states whose predicted values are less than minDiff apart are merged into one state and all the predicited values are recomputed.
除了国家的预测值比minDiff合并成一个国家和所有predicited值重新计算。
参数:model.use
Model selection criterion to use, See find.hmm.states.
模型选择标准使用,请参阅find.hmm.states。
Details
详情----------Details----------
This function is intended to reduce effect of the possible small magnitude technological artifacts on the structure determination.
此功能是为了减少结构测定的影响可能小幅度的科技文物。
值----------Value----------
List containing states.hmm object is returned.
名单包含states.hmm对象返回。
作者(S)----------Author(s)----------
Jane Fridlyand
参考文献----------References----------
array CGH data, Fridlyand et.al., JMVA, 2004
参见----------See Also----------
aCGH, find.hmm.states
aCGH,find.hmm.states
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