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R语言 ABarray包 doANOVA()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 10:55:58 | 显示全部楼层 |阅读模式
doANOVA(ABarray)
doANOVA()所属R语言包:ABarray

                                        Perform one way or two way ANOVA
                                         执行单向或双向方差

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

If only one factor is provided in parameter, one way ANOVA is performed. If two factors are provided, two way ANOVA is performed.
如果只有一个因素在提供参数,访的方式进行。如果两个因素,双向方差。


用法----------Usage----------


doANOVA(eset, group1, group2, snThresh = 3, detectSample = 0.5)



参数----------Arguments----------

参数:eset
An ExpressionSet object.
ExpressionSet对象。


参数:group1
A factor name or labels to test on. If eset is an ExpressionSet object, either name or labels can be used. If eset is an expression matrix, labels should be used.
一个因素的名称或标签上测试。如果ESETExpressionSet对象,无论是名称或标签都可以使用。如果eset是一个表达式,矩阵,标签应使用。


参数:group2
A factor name or labels to test on.
一个因素的名称或标签上测试。


参数:snThresh
Using probes detectable for ANOVA analysis, default S/N value is 3 or more to be considered detectable.
ANOVA分析检测用探针,默认的S / N值是3个或更多的被认为检测。


参数:detectSample
The percentage of samples the probe is detected in order to be considered in ANOVA analysis.
探针检测样本的百分比,以ANOVA分析认为。


Details

详情----------Details----------

At least one group should be provided. If ExpressionSet object is used, group1 or group2 is the name of the sampleGroup defined in experiment design file. If labels are to be used, they can be either numeric or text, e.g., c(1,1,2,2,3,3) or c("treat1", "treat1", "treat2", "treat2", "treat3", "treat3").
应提供至少一组。如果ExpressionSet对象是使用中,group1或group2是实验设计文件中定义的sampleGroup名称。如果要使用标签,他们可以是数字或文字,例如,C(1,1,2,2,3,3)或c(“treat1”,“treat1”,“treat2”,“ treat2“,”treat3“,”treat3“)。

If the probe is detectable in 50% (default) or more samples in any one of the subgroup, it is included in the ANOVA analysis.
如果探针是50%(默认)或在该小组的任何一个样品检测,它包括在方差分析。


值----------Value----------

a vector if one way ANOVA; a matrix if two way ANOVA
向量如果单向方差矩阵如果两个方差分析


作者(S)----------Author(s)----------


Y Andrew Sun



举例----------Examples----------


  #- one way ANOVA[ - 单因子变异数]
#-  anova &lt;- doANOVA(eset, "sampleGroup")[ - 方差< -  doANOVA(ESET,“sampleGroup”)]

  #- two way ANOVA[ - 两因素方差分析]
#-  anova &lt;- doANOVA(eset, "sampleGroup1", "sampleGoup2")   [ - 方差< -  doANOVA(ESET sampleGroup1“,”sampleGoup2“)]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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