R语言 rphast包 hmm()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

hmm(rphast)
hmm()所属R语言包：rphast

                                        Create an rphast HMM object
                                         创建一个rphast的HMM对象

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Create a new HMM object
创建一个新的HMM对象


用法----------Usage----------





参数----------Arguments----------

参数：trans.mat
A square matrix object of dimension n x n where n is the number of states, and element [i,j] is the rate of transition from state i to state j
尺寸的N×N，其中n是对象的状态数和元素[我的方形矩阵，J]转型的速度从状态i到状态j


参数：eq.freq
A vector of length n giving the equilibrium frequencies of each state.  If NULL, calculate equilibrium frequencies that will make a reversible markov chain.
一个向量长度为n的每一个国家的平衡频率。如果为NULL，平衡频率计算，这将使一个可逆马尔可夫链。


参数：begin.freq
A vector of length n giving the initial state frequencies.  If NULL, use equilibrium frequencies.
一个向量长度为n的初始状态的频率。如果为NULL，使用平衡的频率。


参数：end.freq
A vector of length n giving the final state frequencies. If NULL, do not condition on end frequencies.
一个向量长度为n的最终状态频率。如果为NULL，没有条件上年底的频率。


（作者）----------Author(s)----------


Melissa J. Hubisz and Adam Siepel



实例----------Examples----------


h <- hmm(matrix(1, nrow=4, ncol=4))
h

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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