R语言 rphast包 extract.feature.msa()函数中文帮助文档(中英文对照)

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extract.feature.msa(rphast)
extract.feature.msa()所属R语言包：rphast

                                        Extract features from an MSA object...
                                         解压缩功能从MSA对象...

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Extract features from an MSA object
MSA对象特征提取


用法----------Usage----------





参数----------Arguments----------

参数：x
An object of type MSA
MSA类型的对象


参数：features
An object of type features denoting the regions of the alignment to extract.
对象的类型features表示该区域提取的对齐方式。


参数：do4d
If TRUE, then some elements of features must have type "CDS", and only fourfold-degenerate sites will be extracted.
如果TRUE，然后一些元素的功能必须有类型“CDS”，只有四倍退化的网站将被提取。


参数：pointer.only
If TRUE, return only a pointer to an object stored in C (useful for large alignments; advanced use only)
如果TRUE，只返回一个指针的对象存储在C（适用于大的路线，先进的使用）


Details

详细信息----------Details----------

Returns the subset of the MSA which appears in the features object.
返回的功能对象中出现的MSA的子集。


值----------Value----------

An msa object containing only the regions of x
一种msa的仅含有的x的区域的对象


注意----------Note----------

If x was loaded with pointer.only==TRUE, then x will be modified to the return value of the function. Use extract.feature.msa(copy.msa(x), features,...)
如果x被装入用pointer.only==TRUE，那么x将被修改的返回值的函数。使用extract.feature.msa(copy.msa(x), features,...)


（作者）----------Author(s)----------


Melissa J. Hubisz and Adam Siepel



参见----------See Also----------

sub.msa, [.msa
sub.msa，[.msa

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注：
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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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