lassoClass(a4Classif)
lassoClass()所属R语言包:a4Classif
Classify using the Lasso
分类使用的套索
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Classify using the Lasso algorithm as implemented in the glmnet package
作为在glmnet包实施,分类使用套索算法
用法----------Usage----------
lassoClass(object, groups)
参数----------Arguments----------
参数:object
object containing the expression measurements; currently the only method supported is one for ExpressionSet objects
含有表达测量的对象,目前支持的唯一方法是一个ExpressionSet对象
参数:groups
character string indicating the column containing the class membership
字符串,指示列包含类的成员
值----------Value----------
object of class glmnet
对象类glmnet
作者(S)----------Author(s)----------
Willem Talloen
参考文献----------References----------
参见----------See Also----------
glmnet
glmnet
举例----------Examples----------
if (require(ALL)){
data(ALL, package = "ALL")
ALL <- addGeneInfo(ALL)
ALL$BTtype <- as.factor(substr(ALL$BT,0,1))
resultLasso <- lassoClass(object = ALL, groups = "BTtype")
plot(resultLasso, label = TRUE,
main = "Lasso coefficients in relation to degree of
penalization.")
featResultLasso <- topTable(resultLasso, n = 15)
}
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注:
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