cellCycleKO(RobustRankAggreg)
cellCycleKO()所属R语言包:RobustRankAggreg
A dataset based on Reimand et al and Hu et al.
数据集的基础上Reimand等和胡锦涛等人。
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
A dataset based on Reimand et al and Hu et al. It contains lists yeast genes that were most influenced by 12 cell cycle related transcription factor knockouts. The dataset is a list with 3 slots <ol> gl - set of gene lists in a format suitable for aggregateRanks;
数据集的基础上Reimand等和胡锦涛等人。它包含列表中的酵母基因影响最大的12个单元周期相关的转录因子敲除。该数据集是一个列表,3个插槽<OL> gl - 基因列表的格式适合aggregateRanks;
N - number of yeast genes;
N - 酵母基因的数量;
ref - reference list of cell cycle related genes taken from de Lichtenberg et al. </ol>
ref - 引用列表中的单元周期相关基因的利希滕贝格等。 </ OL>
(作者)----------Author(s)----------
Raivo Kolde <rkolde@gmail.com>
参考文献----------References----------
(2010). "Comprehensive reanalysis of transcription factor knockout expression data in saccharomyces cerevisiae reveals many new targets. Nucleic Acids Res."
Hu, Z., Killion, P. J., and Iyer, V. R. (2007). "Genetic reconstruction of a functional transcriptional regulatory network." Nat. Genet., 39(5), 683-7
de Lichtenberg, U., Jensen, L. J., Fausboll, A., Jensen, T. S., Bork, P., and Brunak, S. (2005). "Comparison of computational methods for the identification of
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