综合运用新一代测序与其他组学数据，构建肿瘤细胞演化的数学模型

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综合运用新一代测序与其他组学数据，构建肿瘤细胞演化的数学模型
选择肝癌这一对我国人民健康有重大影响的疾病作为研究对象，收集正常、慢性肝炎、肝硬化、肝癌的序贯样本并应用新一代测序技术进行DNA和RNA测序，利用数据处理与分析方法的研究成果，检测体细胞突变、染色体重排与基因拷贝数变异、启动子甲基化异常和RNA转录后变异等可能与肝癌发生发展过程相关的因素，结合其他组学数据，探索建立肿瘤发生过程的演化数学模型。系统收集多发性肝癌和肝癌血管侵犯（LVI）、淋巴结转移、肺转移、术后复发等样本，通过高通量测序或基因芯片比较原发肿瘤和转移灶、多原发灶及肿瘤复发前后样本之间的差异信号，应用肿瘤发生模型分析转移和复发过程中的信号变化路径，建立肿瘤转移和复发的数学模型。通过动物实验对模型的关键环节进行验证。进一步，通过生物信息学与细胞实验相结合，探索肿瘤干细胞演化模型，利用新一代测序检测肿瘤干细胞在不同刺激条件下的DNA变异水平和甲基化位点动态变化，系统描述肿瘤干细胞自我更新和不对称分化等方面的分子过程。