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新一代高通量测序数据的高效处理方法与工作流

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发表于 2011-8-22 17:13:51 | 显示全部楼层 |阅读模式
新一代高通量测序数据的高效处理方法与工作流
针对新一代测序数据量大、数据处理过程复杂、对计算资源要求高等共同特点,从硬件环境和软件算法两方面入手,对测序数据的典型处理算法进行优化,研究利用GPU(图形处理单元)/FPGA(可编程逻辑门阵列)对算法进行硬件化来大幅度提高系统性能。利用CUDA(统一计算设备架构)编程技术,发展适用于GPU的高通量测序数据处理算法和应用程序。研究可重构工作流技术,发展测序数据处理的可视化交互工作流,实现各种复杂处理流程的快速组装。
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