新一代测序数据所面临的一些问题短序列比对、从头组装、变异位点检测等

lovegene

高效的新一代测序数据基本处理算法和工作流，以及跨平台测序数据的统合分析。不同类型测序技术的数据有各自的特点，但共同特点是数据量大、数据处理过程复杂、对计算资源要求高，这些特点，制约了生物学和医学实验室对测序数据的应用，也构成了将来个体化基因组发展的一个瓶颈。将对各种测序数据的典型处理算法进行优化，发展针对新一代测序数据处理的可视化交互工作流；研究发展利用GPU/FPGA加速器支持的快速算法，包括大量短序列比对、从头组装、变异位点检测等，大大提高常见测序数据处理流程的计算效率；研究对多种测序平台数据以及基因芯片数据的统合分析（meta-analysis），比较不同平台的数据，有效利用平台间技术差异和互补性，并结合人类基因组和变异组数据资源，提升数据质量，消除测序噪声

gnilihzeux

满怀期待的看了一下，可惜只是简单地陈述……