新一代测序数据需要发展的数学模型

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对新一代测序数据产生模型和特点的数学描述，以及在此基础上的新一代测序实验设计理论与方法。深入理解数据产生过程中可能影响数据质量的各个因素，建立数据产生的数学模型，是更好地处理和应用新一代测序数据的基础。新一代测序的发展主要是由测序技术自身的发展推动的，尚缺乏从最终应用角度对不同测序技术中各个影响因素的系统研究。
包括Illumina/Solexa、Roche/454、AB/SOLiD和国产AG-100/200测序系统在内的多种测序平台进行实验设计、误差分析、质量评估和平台比较的研究，也包括对将来第三代测序平台的相应研究，发展新一代测序技术的误差分析和质量控制理论，建立数据分布和测序误差的数学模型，设计具有容错和误差纠正能力的数据处理方法，为后续处理算法提供数据模型指导，也通过对测序误差和质量控制的研究为测序技术本身的发展提供反馈。另一方面，针对测序实验中可以采用的生物条码（barcoding）技术和SOLiD等技术采用的碱基组合编码测序策略，研究在测序技术和实验设计中的编码理论，发展针对不同类型应用的优化实验设计策略和方法。