batchSOM(class)
batchSOM()所属R语言包:class
Self-Organizing Maps: Batch Algorithm
自组织图:批处理算法
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Kohonen's Self-Organizing Maps are a crude form of multidimensional scaling.
Kohonen的自组织映射是一种粗俗的形式,多维尺度。
用法----------Usage----------
batchSOM(data, grid = somgrid(), radii, init)
参数----------Arguments----------
参数:data
a matrix or data frame of observations, scaled so that Euclidean distance is appropriate.
矩阵或观测数据框,缩放,使欧氏距离是合适的。
参数:grid
A grid for the representatives: see somgrid.
为代表的网格:somgrid。
参数:radii
the radii of the neighbourhood to be used for each pass: one pass is run for each element of radii.
附近可用于每个通一通的半径运行的每一个元素的radii。
参数:init
the initial representatives. If missing, chosen (without replacement) randomly from data.
最初的代表。如果缺少,选择(无需更换)随机从data。
Details
详细信息----------Details----------
The batch SOM algorithm of Kohonen(1995, section 3.14) is used.
使用批处理SOM算法的Kohonen网络(1995年,第3.14节)。
值----------Value----------
An object of class "SOM" with components
一个对象的类"SOM"组件
参数:grid
the grid, an object of class "somgrid".
的网格,一个对象的类"somgrid"。
参数:codes
a matrix of representatives.
代表一个矩阵。
参考文献----------References----------
Pattern Recognition and Neural Networks. Cambridge.
Modern Applied Statistics with S. Fourth edition. Springer.
参见----------See Also----------
somgrid, SOM
somgrid,SOM
实例----------Examples----------
require(graphics)
data(crabs, package = "MASS")
lcrabs <- log(crabs[, 4:8])
crabs.grp <- factor(c("B", "b", "O", "o")[rep(1:4, rep(50,4))])
gr <- somgrid(topo = "hexagonal")
crabs.som <- batchSOM(lcrabs, gr, c(4, 4, 2, 2, 1, 1, 1, 0, 0))
plot(crabs.som)
bins <- as.numeric(knn1(crabs.som$code, lcrabs, 0:47))
plot(crabs.som$grid, type = "n")
symbols(crabs.som$grid$pts[, 1], crabs.som$grid$pts[, 2],
circles = rep(0.4, 48), inches = FALSE, add = TRUE)
text(crabs.som$grid$pts[bins, ] + rnorm(400, 0, 0.1),
as.character(crabs.grp))
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