原创——microRNA芯片数据分析

genechip · 发表于 2010-6-11 21:50:35

本人正在研究microRNA芯片数据分析和后期功能注释，因此将以此为切入点全面进行这方面的专题介绍，感兴趣的朋友进来一起交流

lumi microRNA芯片数据分析，包括原始芯片的背景校正，数据标准化，寻找差异microRNA，寻找差异microRNA所调控的基因，受调控基因在KEGG和GO数据库进行功能注释。

上述是microRNA数据分析的基本过程。所用的工具是R语言。
目前我所知道的用于microRNA芯片预处理的R语言包有 lumi package和vst package。因此在做分析之前，请先安装这两个R包。这两个包可以在bioconductor（http://www.bioconductor.org/）数据库中找到，根据不同版本的R（R可在http://www.r-project.org/中下载），需要装上相应版本的lumi和vst package。当然，在安装这两个包的时候，会用到很多其他包，因此此步骤还是要研究怎样装上这两个包。

当你装上这两个包之后，变可以进行后续分析和研究工作了。

待续未完

biostar · 发表于 2010-6-12 18:41:26

顶顶顶，哈哈学习了

湛蓝zpj · 发表于 2012-10-20 22:03:48

谢谢楼主~~赶紧开始吧！！！

kainwar3 · 发表于 2012-11-14 22:46:32

咋还没开始呢？？？都两年了

Brave_Heart · 发表于 2013-3-9 12:43:05

呵呵，来了解芯片技术

Brave_Heart · 发表于 2013-3-9 12:43:07

呵呵，来了解芯片技术

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