R语言 ade4包 dudi.pco()函数中文帮助文档(中英文对照)

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dudi.pco(ade4)
dudi.pco()所属R语言包：ade4

                                        Principal Coordinates Analysis
                                         主坐标分析

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

dudi.pco performs a principal coordinates analysis of a Euclidean distance matrix and returns the results as objects of class pco and dudi.
dudi.pco的欧氏距离矩阵进行主坐标分析，并返回类的对象pco和dudi的结果。


用法----------Usage----------


dudi.pco(d, row.w = "uniform", scannf = TRUE, nf = 2,
    full = FALSE, tol = 1e-07)
## S3 method for class 'pco'
scatter(x, xax = 1, yax = 2, clab.row = 1, posieig = "top",
    sub = NULL, csub = 2, ...)



参数----------Arguments----------

参数：d
an object of class dist containing a Euclidean distance matrix.
对象的类dist包含的欧几里德距离矩阵。


参数：row.w
an optional distance matrix row weights.  If not NULL, must be a vector of positive numbers with length equal to the size of the distance matrix
一个可选的距离矩阵的行权重。如果不是NULL，必须是一个正数的矢量长度相等的距离矩阵的大小


参数：scannf
a logical value indicating whether the eigenvalues bar plot should be displayed
一逻辑值，该值指示是否应显示的特征值条形图


参数：nf
if scannf FALSE, an integer indicating the number of kept axes
如果一个整数，表示数量的不断scannf FALSE，轴


参数：full
a logical value indicating whether all the axes should be kept
一逻辑值，指示是否所有的轴应保持


参数：tol
a tolerance threshold to test whether the distance matrix is Euclidean : an eigenvalue is considered positive if it is larger than  -tol*lambda1 where lambda1 is the largest eigenvalue. </table>
容差阈值，以测试是否是欧氏距离矩阵的特征值被认为是正面的，如果它是大于-tol*lambda1其中lambda1是全球最大的特征值。 </ TABLE>


参数：x
an object of class pco
一个对象的类pco


参数：xax
the column number for the x-axis
的x-轴的列数


参数：yax
the column number for the y-axis
的列数为y轴


参数：clab.row
a character size for the row labels
字符大小行标签


参数：posieig
if "top" the eigenvalues bar plot is upside, if "bottom" it is downside, if "none" no plot
如果“顶”的特征值的条形图的上升空间，如果“底”，这是缺点，如果“没有”没有图


参数：sub
a string of characters to be inserted as legend
像传说中要插入一个字符串中的字符


参数：csub
a character size for the legend, used with par("cex")*csub
字符大小的传说，使用par("cex")*csub


参数：...
further arguments passed to or from other methods
进一步的参数传递给其他方法


值----------Value----------

dudi.pco returns a list of class pco and dudi. See dudi
dudi.pco类pco和dudi返回一个列表。见dudi


（作者）----------Author(s)----------



Daniel Chessel <br>
Anne B Dufour <a href="mailto:dufour@biomserv.univ-lyon1.fr">dufour@biomserv.univ-lyon1.fr</a>




参考文献----------References----------



实例----------Examples----------


data(yanomama)
gen <- quasieuclid(as.dist(yanomama$gen))
geo <- quasieuclid(as.dist(yanomama$geo))
ant <- quasieuclid(as.dist(yanomama$ant))
geo1 <- dudi.pco(geo, scann = FALSE, nf = 3)
gen1 <- dudi.pco(gen, scann = FALSE, nf = 3)
ant1 <- dudi.pco(ant, scann = FALSE, nf = 3)
plot(coinertia(ant1, gen1, scann = FALSE))

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