用plink做全基因组关联分析，期待找到一段杂合子片段与性状相关，怎么分析？

nasi · 发表于 2012-6-2 23:11:53

推测目标性状是由杂合子造成的，怎么用plink软件做关联分析，找到这个杂合子片段？case-control的分析手段可以吗？
请各位多多指教！

xiaoliu · 发表于 2012-6-3 09:39:10

杂合子造成的？难道是超显性？
SNP的关联分析，首先要满足哈代温伯格平衡，也就是，AA，Aa，aa要满足，p^2, 2pq, q^2的比例关系，
纯的杂合子好像有问题

nasi · 发表于 2012-6-4 11:46:06

xiaoliu 发表于 2012-6-3 09:39
杂合子造成的？难道是超显性？
SNP的关联分析，首先要满足哈代温伯格平衡，也就是，AA，Aa，aa要满足，p^2 ...

一定要满足哈温平衡吗？所用的群体不是随机群体呀。

xiaoliu · 发表于 2012-6-4 23:18:04

那做case control貌似有问题

账号		自动登录	找回密码
密码			注册