R语言 yaqcaffy包 getOutliers()函数中文帮助文档(中英文对照)

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getOutliers(yaqcaffy)
getOutliers()所属R语言包：yaqcaffy

                                         Get outliers for the different YAQCStatsObject slots
                                         获取离群的不同YAQCStatsObject插槽

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function retrives the outliers fot the different quality control metrics stored in a YAQCStatsObject. Outliers are defined as being outside of the  mean +/- 2 stdev range or mean/2, mean*1.5 for the scale factor.
这的功能retrives离群FOT不同的质量控制在YAQCStatsObject存储指标。离群点被定义为以外的平均+ /  -  2的STDEV范围或等于/ 2，平均* 1.5的比例因子。


用法----------Usage----------


  getOutliers(YAQCStatsObject,slot)



参数----------Arguments----------

参数：YAQCStatsObject
an object of type "YAQCStats"  
对象类型"YAQCStats"


参数：slot
an object of type string describing the slot for which  the outliers should be retrieved (see details for possible  slot strings)  
类型的对象string描述为离群应撷取插槽（见可能插槽字符串的详细信息）


Details

详情----------Details----------

The slot strings that can be used are:
插槽可用于字符串是：




scale factor "sfs"
规模因素“SFS”




average background  "avbg"
平均背景avbg“




average noise "avns"
平均噪音“avns”




percentage present "pp"
百分比目前“PP”




β-actin 3'/5' ratio "actin"
β-肌动蛋白3/5“比”肌动蛋白“




GAPDH 3'/5' ratio "gapdh"
GAPDH的3/5的比例“GAPDH”




internal bioB control "biob"
bioB内部控制“biob”




internal bioC control "bioc"
bioC内部控制“bioc”




internal bioD control "biod"
内部的biod控制“的biod”




Dap spike control "dap"
DAP穗控制“磷酸二铵”




Thr spike control "thr"
苏氨酸穗控制“THR”




Phe spike control "phe"
苯丙氨酸穗控制“苯丙氨酸”




Lys spike control "lys"
赖氨酸穗控制“赖氨酸”


值----------Value----------

An object of type "numeric" giving the outliers names and values
一个对象的类型"numeric"给离群的名称和值


作者（S）----------Author(s)----------


Laurent Gatto



举例----------Examples----------


  ## load data[＃加载数据]
  library(MAQCsubsetAFX)
  data(refA)
  ## create the yaqc object[＃创建yaqc对象。]
  qobj <- yaqc(refA[, 3:5])
  ## get outliers for the scale factor[＃得到离群值的比例因子]
  getOutliers(qobj, "sfs")

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注：
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