R语言 XDE包 ssStatistic()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

ssStatistic(XDE)
ssStatistic()所属R语言包：XDE

                                        Calculate single study estimates of effect size
                                         计算规模效应的单一研究估计

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Calculate single study estimates of effect size for lists of ExpressionSets
计算列表ExpressionSets单一的研究估计，规模效应


用法----------Usage----------


ssStatistic(statistic = c("t", "sam", "z")[1], phenotypeLabel, esetList, ...)



参数----------Arguments----------

参数：statistic
Character string indicating Welch t-statistic (t), SAM (sam), or a z-statistic (z)
字符串表示韦尔奇ţ统计（T），萨姆（Sam），或Z-统计量（Z）


参数：phenotypeLabel
Character string indicating the name of the binary covariate
字符串表示二进制协变量的名称


参数：esetList
An object of class ExpressionSetList
一个对象的类ExpressionSetList


参数：...
Not implemented. Potentially additional arguments to the above methods that are implemented in other packages
没有落实。潜在的额外的参数，以实现上述方法，在其他包


Details

详情----------Details----------

This function is a wrapper that provides an estimate of effect size for each study (element) in an ExpressionSetList object.
这个函数是一个包装，提供每个研究估计的规模效应，ExpressionSetList对象（元）。

For Welch t-statistic, this function is a wrapper for mt.teststat in the multtest package.
韦尔奇t-统计，此功能是在multtest包mt.teststat包装。

For SAM, this function is a wrapper for the sam function in the siggenes package.
在SAM中，这个功能是SAM在siggenes包功能的包装。

The "z" statistic is a standardized unbiased estimate of effect size (Hedges and Olkin, 1985) – implementation is in the zScores function in the R package GeneMeta.
“Z”的统计数据是一个标准化的规模效应的无偏估计（对冲和Olkin型，1985） - 执行是在R包GeneMeta zScores功能。

See the complete references below.  
看到下面的完整参考。


值----------Value----------

A matrix: rows are genes and columns are studies
一个矩阵：行是基因和列研究


作者（S）----------Author(s)----------


R. Scharpf



参考文献----------References----------

microarray studies and modeling interstudy variation, Bioinformatics, 19(1) I84-I90.
for microarray data hypothesis Test 12(1) : 1-44 (with discussions on 44-77).
Throughput Experiments
(1985), Academic Press
applied to the ionizing radiation response, PNAS 2001 98: 5116-5121, (Apr 24).

举例----------Examples----------



data(expressionSetList)
if(require(siggenes)){
  sam <- ssStatistic("sam", esetList=expressionSetList, phenotypeLabel="adenoVsquamous")
}  

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。