R语言 xcms包 specNoise()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

specNoise(xcms)
specNoise()所属R语言包：xcms

                                        Calculate noise for a sparse continuum mass spectrum
                                         计算噪声稀疏连续质谱

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Given a sparse continuum mass spectrum, determine regions where no signal is present, substituting half of the minimum intensity for those regions. Calculate the noise level as the weighted mean of the regions with signal and the regions without signal. If there is only one raw peak, return zero.
由于稀疏连续质谱，确定不存在信号的区域，为这些区域的最低强度代的一半。作为信号和无信号的区域，区域的加权平均计算的噪音水平。如果只有一个原始的高峰，返回零。


用法----------Usage----------


specNoise(spec, gap = quantile(diff(spec[, "mz"]), 0.9))



参数----------Arguments----------

参数：spec
matrix with named columns mz and intensity
矩阵命名列mz和intensity


参数：gap
threshold above which to data points are considerd to be separated by a blank region and not bridged by an interpolating line  
阈值以上的数据点considerd被分隔的一个空白区域，而不是桥接插线


Details

详情----------Details----------

The default gap value is determined from the 90th percentile of the pair-wise differences between adjacent mass values.
默认的差距值确定从相邻的质量值之间的差异成对的第90百分位。


值----------Value----------

A numeric noise level
一个数字的噪音水平


作者（S）----------Author(s)----------


Colin A. Smith, <a href="mailto:csmith@scripps.edu">csmith@scripps.edu</a>



参见----------See Also----------

getSpec, specPeaks
getSpec，specPeaks

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注：
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