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R语言 xcms包 group.density()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 16:06:25 | 显示全部楼层 |阅读模式
group.density(xcms)
group.density()所属R语言包:xcms

                                        Group peaks from different samples together
                                         从不同样品组峰

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Group peaks together across samples using overlapping m/z bins and calculation of smoothed peak distributions in chromatographic time.
集团高峰跨样品的色谱重叠的m / z箱和平滑的峰值分布计算。


参数----------Arguments----------

参数:object
the xcmsSet object
xcmsSet对象


参数:minfrac
minimum fraction of samples necessary in at least one of the sample groups for it to be a valid group  
样品必要的最低分数至少在它的样本群体之一,是一个有效的组


参数:minsamp
minimum number of samples necessary in at least one of the sample groups for it to be a valid group  
最低所需样品数量至少在它的样本群体之一,是一个有效的组


参数:bw
bandwidth (standard deviation or half width at half maximum) of gaussian smoothing kernel to apply to the peak density chromatogram  
带宽高斯平滑核心(标准偏差或半高半宽)适用于峰值电流密度色谱


参数:mzwid
width of overlapping m/z slices to use for creating peak density chromatograms and grouping peaks across samples  
重叠的m / z片用于创建峰值密度色谱和分组各样品的峰宽


参数:max
maximum number of groups to identify in a single m/z slice  
最大的群体数量,以确定在一个单一的m / z片


参数:sleep
seconds to pause between plotting successive steps of the peak grouping algorithm. peaks are plotted as points showing relative intensity. identified groups are flanked by dotted vertical lines.  
秒暂停之间绘制的高峰期分组算法的连续步骤。峰绘制点,呈现出相对强度。鉴定组虚线垂直线两侧。


值----------Value----------

An xcmsSet object with peak group assignments and statistics.
xcmsSet峰集团分配和统计对象。


方法----------Methods----------

     group(object, bw = 30, minfrac = 0.5, minsamp = 1,      mzwid = 0.25, max = 50, sleep = 0)   
     group(object, bw = 30, minfrac = 0.5, minsamp = 1,      mzwid = 0.25, max = 50, sleep = 0)   


参见----------See Also----------

xcmsSet-class, density
xcmsSet-class,density

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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