R语言 xcms包 findPeaks.MSW-methods()函数中文帮助文档(中英文对照)

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findPeaks.MSW-methods(xcms)
findPeaks.MSW-methods()所属R语言包：xcms

                                        Feature detection for single-spectrum non-chromatography MS data
                                         单频非色谱 - 质谱数据的功能检测

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Processing Mass Spectrometry direct-injection spectrum by using wavelet based algorithm.
加工质谱直喷式频谱利用基于小波的算法。


参数----------Arguments----------

参数：object
xcmsSet object
xcmsSet对象


参数：snthresh
signal to noise ratio cutoff
信号噪声比截止


参数：scales
scales of CWT
尺度小波变换


参数：nearbyPeak
Determine whether to include the nearby small peaks of major peaks. TRUE by default
确定是否包括重大峰附近的小峰。 TRUE，默认情况下，


参数：sleep
number of seconds to pause between plotting peak finding cycles  
暂停之间绘制峰寻找周期秒数


参数：verbose.columns
additional peak meta data columns are returned   
额外的峰值元数据列返回


Details

详情----------Details----------

This is a wrapper around the peak picker in the bioconductor package MassSpecWavelet calling 'cwt', 'get.localMaximum.cwt', 'get.ridge', 'identify.majorPeaks' and tuneIn.peakInfo.
这是一个调用“CWT”，“get.localMaximum.cwt，get.ridge，identify.majorPeaks”和tuneIn.peakInfo在bioconductor包MassSpecWavelet高峰选择器周围的包装。


值----------Value----------

A matrix with columns:
一个矩阵的列：


参数：mz
m/z value of the peak at the centroid position  
m / z值的高峰期在质心位置


参数：mzmin
m/z value at the start-point of the peak  
m / z值在高峰期的起始点


参数：mzmax
m/z value at the end-point of the peak  
m / z值在高峰期的结束点


参数：rt
always -1  
总是-1


参数：rtmin
always -1  
总是-1


参数：rtmax
always -1  
总是-1


参数：into
integrated area of original (raw) peak  
综合区原（原）高峰


参数：maxo
intensity of original (raw) peak at the centroid position  
原（原）峰的强度在质心位置


参数：intf
always NA   
始终不适用


参数：maxf
maximum MSW-filter response of the peak  
最大的城市生活垃圾过滤器的峰值响应


参数：sn
Signal/Noise ratio
信号/噪声比


方法----------Methods----------

     findPeaks.MSW(object, snthresh=3,     scales=seq(1,22,3), nearbyPeak=TRUE,     peakScaleRange=5, amp.Th=0.01,     minNoiseLevel=amp.Th/SNR.Th,     ridgeLength=24, tuneIn=FALSE,     sleep=0, verbose.columns = FALSE)     
     findPeaks.MSW(object, snthresh=3,     scales=seq(1,22,3), nearbyPeak=TRUE,     peakScaleRange=5, amp.Th=0.01,     minNoiseLevel=amp.Th/SNR.Th,     ridgeLength=24, tuneIn=FALSE,     sleep=0, verbose.columns = FALSE)     


作者（S）----------Author(s)----------


Steffen Neumann, Joachim kutzera, <a href="mailto:sneumann|jkutzer@ipb-halle.de">sneumann|jkutzer@ipb-halle.de</a>



参见----------See Also----------

findPeaks-methods xcmsRaw-class peakDetectionCWT
findPeaks-methodsxcmsRaw-classpeakDetectionCWT

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注：
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